尊者说：“令人高兴的事么？那也许是由精进而得来的成果，超度一切人与非人（‘非人’藏文是Mis ma yin，意思是凡非人类的一切精灵，阿修罗及其他的鬼神都统称非人）和弘扬佛法的事迹吧！”
惹琼巴问道：“你是先超度人的呢？还是先超度非人的呢？”
尊者说：‘起初有许多非人来向我挑战，我就降伏他们，以后又超度了他们。以后又超度了许多人类的徒弟。最后长寿王神女来显示神通向我挑战，我又超度了她。我的教法在非人中，长寿王神女将为继承光大者；在人类中则乌巴顿巴（即冈波巴大师）将为弘扬光大者。”
色问惹巴就请问尊者道：“尊者！您主要的修行地方是那其贡雪山和曲巴两处，除此之外，您还在其他什么地方修行过呢？”
尊者说：“我修行的地方有尼泊尔的约莫贡惹和六大出名山窟、六小隐名山窟和六个秘密山窟，连同另外两处，一共是二十处山窟。另外尚有四个出名的大山洞，有四个不出名的山洞，还有其他各处山间有缘会的小洞。在这些地方修行的结果，我已经证到“无有可修的法，无有能修的人’的境界。现在我已没有什么可修的了。”
惹琼巴说：“尊者法性尽地的无缘大悲，使我们徒众得到了无颠倒的正见和坚固的信心，我们心中非常的快乐，真是感谢您老人家。现在为了利益未来的众生，可否请您告诉我们外、内、密各处修行胜地的名称？”
尊者说：“有名的外山窟有六个，就是：
护马白崖窟、明雀只马窟、饮哇著马窟
惹马菩提窟、将潘郎卡窟、著甲多结窟
不著名的内山窟有：
结巴尼马窟、库虚问巴窟、谢普去薪窟
白则多盐窟、则巴刚替窟、琼龙庆给窟
秘密的山洞有六处：
甲照郎卡窟、到碰生给窟、白普麻母窟
来普白马窟、龙哥卢多窟、著甲多结窟
其他二处是：
结普尼马窟、播它郎卡窟
四大著名的山洞是：
雅龙的著巴普、来喜的多肚、亭日的哲借普、的色的真处普
不出名的四个山洞是：
咱地的刚楚窟、绒地的俄萨窟、惹那的则俄窟、古通的播绒窟
在上面说的这些山窟中修行，可以得到顺缘和传承的加持。你们应该到这些地方去修行。”
尊者说完了他的故事，参加法会的会众，对佛法都生起了信仰和厌世出离及慈悲的心，大家都对世间八法极生厌离，虔诚慕乐正法。
尊者的大弟子们，都向尊者发愿：愿意断舍世欲，终生精进修法，作利益众生的事业。天神诸弟子也都发愿维护佛法。世俗的听众中，有很多上根的人，都皈依了尊者作为弟子，如法修行，终于成为得证实相境界的瑜珈行者。中根的人，都愿以月计或以年计来专门修法。下根的人，也决定终身不做恶事，常做善业。参与闻法的大众都得到了究竟的利益。
以上是尊者自述的传记，由他的弟子们所记录的。尊者一生的事迹，如果详细叙说，可以分为三大类：第一是非人的神鬼向尊者的挑战和尊者降伏超度他们的事迹；第二是对诸具有善根大弟子的化度和成功的事迹；第三是对一般弟子及普通世人说法及其他应化的事迹。
关于化度非人的事迹，大致说来：
尊者在红崖谷降伏魔王毕那牙嗄，而说《六种忆念上师法》。此后尊者依马尔巴上师嘱，赴那其贡修行。在那其贡雪山调伏了许多山神，在当地说了《那其去宋法要》。次年，尊者往那其雪山中窟，说众所闻名之《雪山大歌集》。此后又依上师嘱，往芒地德燃山及尼泊尔之约母雪山。继乃回至贡通饮哇崖，说《魔母歌集》。然后往德燃山惹马菩提窟降伏女神，说《降神歌要》。又先后往展利虚空窟，及生嗄那森林狮虎窟。调伏人与非人，为数极众。既而尊者返回西藏，常住深山之中，以修行示现而度众生；在西藏贡通某山窟中，说《鸽诗集》。
尊者化度诸大弟子的事迹，可略述如次：
尊者居白崖金刚窟，广利众生。其时金刚瑜珈母为尊者授记诸弟子之缘起，得空行耳传口授之弟子惹琼巴金刚称特别授记。尊者往贡通普利崖时，遇心子惹琼巴。后来惹琼巴赴印度治病，返后与尊者同住雍普光明窟（此山窟不在所授记之三十个山窟之内，《密勒歌集（Mila Grubum）》中曾提到）。尊者复于惹马菩提窟遇惹巴佛护。于鸭龙著窟为昔已皈依之弟子觉放释迦古那授灌顶及口诀而化度之。于雄打各遇罢打马，于归途中遇色问惹巴，于上喜热遇只贡巴，于冬惹良遇惹巴寂光，于剑龙遇俄踪惹巴；后来又到那其雪山修行，空行母嘱尊者往的色，途中遇当巴甲普。于哥鸟各遇卡琼惹巴，于贡市遇打马网去。复上行至的色，以神通法降伏那若般琼。下归至白崖金刚窟遇若郡惹巴。时空行母又嘱另往一处所，发现了密洞麻母窟，尊者住了数日，遇一牧羊童子，其名为乐则惹巴，他日后得了大成就。于来普莲花崖遇谢贡惹巴，他以善妙饮食供养尊者。于觉罗成遇惹琼妈，于蒙尼香遇岂惹巴。因此尊者之名传扬十方。又因度母授记，故尊者度可可马国王；自后国王时时供养尊者。旋惹琼巴与谢贡惹巴迎师返那其雪山多念元窟；次年住郡龙窟（此二山窟不在所授记之三十个山窟之内，《密勒歌集》中曾提到）。再赴曲巴为长寿女次第演说《长寿女王歌集》。于亭日遇惹巴多杰自在。后来尊者住在鸭龙著普时，印度的打马菩提前来参见。以此种种因缘，尊者名益大显。有一个博学善辩的喇嘛与尊者兴辩，尊者以神通将他折服，说《惹琼的补歌集》。于著普遇梅贡惹巴。于鸭龙遇萨来俄。尊者赴著马托显时，适值惹琼巴自印度回来，尊者去迎接他，说《牛角歌》及《野驴歌》。接着又到曲巴，遇达波领贡惹巴。又于亭日吉祥快乐坡遇释迦文佛于《悲华经》中所授记的大士，心子最胜士夫密行比丘，大菩萨月光童子，为利益众生事业的缘故，投生人世，示医师相，称做抑未达波那结（意为达被无比良医，即冈波巴大师）。
又于曲巴俄马琼住时，化度昔日敌视尊者之罗顿比丘。于结普太阳窟遇折顿吉祥光。诸比丘中，因里果普汝对尊者礼拜的缘故，以致大众也都皈依了正法。
空行母曾授记：尊者之弟子中有二十五人得大成就。其中如心弟子八人；如子弟子十三人；如女弟子四人。其化度之经过，具载于《大歌集》中。
第三、关于尊者其他应化等事迹。歌传中所记载，与内密诸山窟中，遇诸如心弟子的时间，稍有出入之处。其中有答比丘问及答弟子问等歌颂，与冈波巴同住时说《降伏笨教歌颂》。于鸭龙有灌顶及开光等歌颂，及咱马谢多与来色歌颂，又说《无惧乐死歌》。后与惹琼巴赴那其时说《降魔歌》及《除忧歌》。后又说《让顶郎普歌》。后由诸弟子迎请住于鸭龙普著，尊者受惹琼巴请，自说传记。空行狮王佛母为缘助，使印度大成就者当巴桑结与尊者于贡通相遇。在来醒说《死法悲钩歌》及《报母恩歌》。对咱马雅等鸭龙人说《死别歌》。于去俄说《顶日那杰雍日歌》。于曲巴说《入中后世歌》、《真言问答歌》。为了令诸弟子雀跃欢喜，更示现诸神通事迹。
尊者以种种方便转大法轮，以不可思议方便，令无量上、中、下根有缘众生成熟解脱。上根者得大成就，中根者成其道，下根者也发菩提心、行菩萨行。于无根诸人也广播善法种子习气，令得人天快乐。悲心广大与虚空等，光耀佛法如旭日升天；使无量众生，除恶道苦，脱轮回缚；于无量痛苦生死海中，作大救护，为大依怙，其恩德事业诚不可思议也。
入灭因缘
尊者经过了无量利生的事业，最后在亭日地方，遇到一位名叫操普博士的行者。操普爱财如命，可是因为他是学者，亭日地方的老百姓很恭敬他；每逢有宴会的时候，总是让他坐在上首。在他见到尊者后，表面上表示恭敬信仰，实际是内怀妒忌。屡次在众人集会之前，故意向尊者提出许多难题，想使尊者当堂出丑，但总未成功。
在木虎年秋季第一日，亭日村民召集了一个大宴会，请尊者坐在最上首，操普博士坐在第二位上。
操普博士在会众之前向尊者顶礼，心里想尊者一定会还他的礼的。但是尊者一向的习惯，除了对上师顶礼之外，决不向任何人顶礼，所以就没有回操普博士的礼。操普博士因而很不平，心中暗想：我这样博学多才的学者，向他这样一个毫无学问的人顶礼，他居然不回礼，高坐上首，昂然不动；真是岂有此理，非要报复一下不可！于是就拿了一本因明的论典，放在尊者的面前说：“请你把这本书逐字讲解，解答疑问，同时发挥所见，并加评述！”
尊者说：“论典的语义，你也许都能逐句讲解，但是真正的意义，是克服世间八法的欲望和降伏我执，以轮回、涅槃一味而清净法执。除此之外，那些教人如何问如何答的论辩之学，根本没有什么大用处，所以我没有学过，更是不懂；如果亦曾学过，或是曾经了解过，现在也早已忘记了。忘记的理由，请听我这首歌：
敬礼译师马尔巴前，远离言说祈加持；
为有上师加持力，此心不受动摇害。
恒修慈爱与悲悯，遂忘自他之执着。
顶戴上师恒修观，遂忘威势之官府。
不离本尊而修观，遂忘卑小蕴、界、处。
思维耳传之口诀，遂忘文字与经典。
守护本来平常心，遂忘无明之误谬。
自身观作佛三身，遂忘希冀与畏怖。
此生来生平等观，遂忘死生之恐惧。
护持证解独自居，遂忘亲朋之照顾。
一心定慧之进益，遂忘宗派之异同。
思维生灭皆无实，遂忘教义宗派见。
思维现象皆法身，遂忘着相之修观。
无整宽坦而安住，遂忘世间礼仪行。
身语归住于下位，遂忘富贵之骄淫。
以此幻身作我庙，遂忘各自宗派寺。
言语道断为作证，遂忘诠表解说义。
言诠义语君能说，请君勿为法所执！
操普博士说：“像你们这样专门修行的人，当然是用这一套话来回答；但是我们讲学理的，依着逻辑的道理来思辩，则你所说的话，全不合佛法的大义。我因为你是一个好人，才向你顶礼的……。”嘴里唠唠叨叨地还在讲。
施主大众听了，大不满意。大家一致说道：“博士！无论你知道多少佛法教理，像你这样的人遍地皆是，塞满了世界都装不满尊者一根毛孔！你还是不要做声，安份的做做我们的上席；想法子去增加你的财产好了，不要再在法会上出丑了！”
他听了勃然大怒，但是怯于众怒难犯，就是大闹一场也无胜算。只得怒气冲冲的硬忍下去。嘴里虽是默默无言，心中却好不懊恼，暗自盘算道：“这一个无知识的密勒日巴，行为疯狂，口说梦话；以虚言妄语来欺骗大众，赚他们的供养，为佛法丢脸！像我这样有学问、有声望、有财产的博士，在法的一方面看来，大家看我却比狗还不如，真是岂有此理！这非想个办法不可！”
这位操普博士，在布林村上有个情妇。他就叫这个女人在奶酪里面放了毒药，拿去供养尊者，准备毒死他。操普答应这女人如将此事办妥，一定送她一块大碧玉。这个女人以为他说的话是真的，就把毒药放在奶酪里面到崖城来供养尊者。那时尊者早已知悉一切。尊者观察因缘，知道有缘的众生都已经化度。毒药虽不能伤害自己，但自己涅槃的日子也将到了，就准备接受毒药的供养。但是尊者知道：如果在供养毒奶以前，这个女人没有拿到玉石，那么，她就再也不会得到了。因为操普博士是决不会再把玉石给她的。所以尊者就对这个女人说：“现在我不要吃，请你以后再拿来，也许那时我就要吃了。”
她听了尊者的话，心中又疑惑又害怕，猜想尊者大概已经知道奶里有毒了，就在十分不安的情绪中回去了。
她见了操普博士，就把经过的情形告诉他，并且说尊者一定有神通所以不肯吃。
操普说：“哼！他要是有神通的话，就不会叫你以后再拿给他，或是会叫你自己把这毒奶吃掉的！他不这样做而叫你以后拿来，明明表示他没有神通。现在你先把这块玉石拿去罢，你再把奶酪拿给他，你这次去一定要他吃掉！”于是就把玉石给她了。
她说：“大家都相信他一定是有神通的，因为他有神通所以昨天没有吃。今天再拿去，他也决不会吃的。我怕得很，不敢去，我宁愿不要这块玉石。请你宽�