即使遭遇到了最有战斗力的苏联空军部队，但德国空军仍占了很大的优势，２５日４架由德第７７战斗机联队第２大队Walter Hoeckner中尉率领的Ｂｆ－１０９，拦截了有ＭｉＧ－３护航的１２架ＳＢ，德国人击落１０架ＳＢ，其中Hoeckner中尉一人击落了８架。２５日后，德国空军的任务从攻击苏空军机场转到了对进攻的德军进行密集支援上，这种支援对德国地面部队十分重要，因为德第１装甲集团正遭到了装备着Ｔ－３４和ＫＶ坦克的苏联部队的强大反攻。在２５和２６日两天，德国第３战斗机联队和第２训练联队第１大队宣称击落了１００架以上苏联飞机，其中大部份是ＳＢ和ＤＢ－３。德军损失了６架Ｂｆ－１０９，其中第３战斗机联队第２大队大队长Lothar Keller上尉，一个击落了２０架敌机的王牌飞行员，被击落身亡。
在苏联－罗马尼亚边境上，苏第５５战斗机团的飞行员们正经历着一场苦战，２６日波克雷什金上尉击落了２架德国Ｈｓ－１２６侦察机。２７日６架第５５战斗机团的ＭｉＧ－３，在团长Victor Ivanov 少校带领下出发战斗巡逻，他们遇上了一架德国Ｈｓ－１２６，苏联飞行员们把这个战果“礼让”给团长，Ivanov以一阵准确的扫射击落了那架德机，俄国人还来不及庆祝，就在返回的路上，１架ＭｉＧ－３可能由于机械故障，忽然坠毁在地面上。剩下的５架ＭｉＧ－３在稍后发现了一个德国运输车队，苏机立刻俯冲扫射，就在他们拉起来时，８架德第７７战斗机联队第２大队的Ｂｆ－１０９以高速向他们扑来，波克雷什金立刻迎向敌机，但就在这时，他震惊地发现Ivanov和其他人竟丢下他跑了！见此情形，德国人立刻分为两组，４架对付波克雷什金，另４架追击逃跑的其他苏机。费力九牛二虎之力，波克雷什金才摆脱了德机的攻击，当他返回机场落地时，有人告诉他Ivanov已经回来了，在逃跑的途中，有１架ＭｉＧ－３被击落，这是德第７７战斗机联队第５中队的Rudolf Schmidt上士的第１５次空战胜利。几个小时后，一个德国轰炸机群来到了苏军机场上空，波克雷什金、Leonid diyachenko 少尉和Nikolay Lukashevich少尉立刻起飞迎敌，在随后的空战中，波克雷什金和Diyachenko各击落了１架Ｊｕ－８８。
这时护航的４架Ｂｆ－１０９立刻扑向了他们，Diyachenko当即被德第７７战斗机联队第５中队的Hans Esser下士击落，Lukashevich 少尉则宣称击落了１架Ｂｆ－１０９，德第５中队的Loy下士毁机迫降在回航途中。
在战争的第一个星期中，波克雷什金共击落了６架德国飞机（３架Ｂｆ－１０９、１架Ｊｕ－８８、２架Ｈｓ－１２６）但由于在混乱中，第５５战斗机团的档案全部遗失，这些战绩从未被承认。对此他甚为不满，他一直宣称他的战绩不应是官方宣布的５９架，而应是７２架，如果真如此，波克雷什金将超过阔日杜布的６２架和Ｇ·Ａ·Rechkalov的６１架而成为盟国一方的第一王牌。
（Mars注，他似乎忘了那架Ｓｕ－２。）
在对罗马尼亚进行了几次空袭后，苏联空军扩大了攻击范围，他们甚至把罗马尼亚手首都布加勒斯特也包括了进去，由于没有战斗机护航，这些苏联脆弱的ＳＢ轰炸机执行的实际上是一项自杀性任务。６月２６日，苏联轰炸机群随同一支苏联舰队前往攻击罗马尼亚海岸。在途中，苏联轰炸机遭到了德国第５２战斗机联队第８中队和第７７联队第３大队的Ｂｆ－１０９的攻击，几乎每个参战的德国飞行员都声称击落了敌机，其中Emil Omert少尉和Reinhold Schmetzer士官长各声称击落了５架敌机，第５２战斗机联队第８中队中队长Gunther Rall中尉回忆到“这是一个容易的任务，因为俄国人没有任何战斗机护航”，据苏方记录，只有９架ＳＢ轰炸机被击落。
另外大型炮舰Moskva号被罗马尼亚人的水雷炸沉，另一艘炮舰哈尔科夫号被罗马尼亚海岸炮击伤。
罗马尼亚空军也在准备执行一项任务，匈牙利霍尔第政府很想加入德国的阵营，但其国内有不少反对的阻力，于是经过精心策划，３架罗马尼亚P。37轰炸机伪装成苏联飞机轰炸了匈牙利境内目标，造成了３２人死亡，２８０人受伤。于是匈牙利立刻向苏联宣战。第二天匈牙利空军对苏联境内目标发动了攻击，在这次攻击中，１架匈牙利Ｈｅ－１７０战斗机被苏联战斗机击落，飞行员Laszlo Bardossy中士被俘。苏联空军对此的反应是在两天后，对匈牙利境内铁路中心Csap进行了轰炸，在这次攻击中匈牙利空军第２战斗机中队的CR。 42战斗机击落了３架ＳＢ。与此同时，德国第５１、５４和５５轰炸机联队对苏军地面部队展开了密集轰炸，在６月２２日～３０日间，德国空军宣称击毁了２０１辆苏联坦克，在德国空军的支援下，德国地面部队成功地击退了苏军的反攻。
在苏德战争的头９天证明了，即使是最好的苏联空军部队仍无法抵御德国空军的进攻，在此期间，苏联南方方面军空军损失了５８架新式的ＭｉＧ－３，而苏联的轰炸机部队则遭到了大屠杀。对德国人来说，胜利似乎近在眼前。但同时一些不详之兆开始浮现了，虽然苏联空军遭到了沉重打击，可是出乎德国人意料的，苏军没有屈服，他们的反击从未停止。
这使德国空军受到了重大伤亡，在这９天中，据德方记录，德国空军共损失了６９９架飞机，其中２８６架是轰炸机，（苏联方面宣称在这９天里，苏联战斗机击落了６１３架德机，高射炮部队击落了４９架德机，看来这个数字与实际相差不远）战损加上机械故障使６月３０日德国空军在整个苏联战场上可运作的飞机数下降到了９６０架！
事实表明了德国人低估了苏联的实力，这个战略性的错误是无法用战术上的胜利来弥补的。八
在北方战场，德国第１航空队在战争的头几天沉重打击了苏联西北方面军的空军部队，在６月２２日到３０日之间，苏西北方面军空军共战损飞机４２５架，另有４６５架飞机被摧毁于地面。２２日时全部４０３架ＳＢ轰炸机中，２０５架被击落，１４８架被摧毁于地面，３３架受损。此外１１５架Ｉ－１５３，８１架Ｉ－１６和１７架ＭｉＧ－３被击落。
７月１日德国北方集团军群抵达了Daugava 河，从而把拉脱维亚一切为二，苏军一切阻止德军攻势的企图都失败了，在战斗中德国空军宣称摧毁了２５０辆苏联坦克。
由于苏西北方面军和波罗的海的海军航空军已遭到重创，苏最高统帅部下令北方方面军的空军部队以全力攻击德第４装甲集团，在７月１日，苏第２混合空军师开始攻击德军地面目标，在这一天中，德第５３“黑桃Ａ”战斗机联队第２大队宣称击落了１０架苏机，第５４“绿心”战斗机联队击落了２架苏机。
第二天早晨，德第４装甲集团渡过了Daugava 河，并接近了旧苏联国界，苏北方方面军的轰炸机部队冒着大雨轰炸了Daugava 河上的渡口，德第５４战斗机联队在这一地区击落了１２架苏联轰炸机。被击落的ＳＢ中的一架是苏第４４快速轰炸机团的Pavel Markutsa上尉驾驶的，他的飞机遭到了５架Ｂｆ－１０９的集中攻击，他的机尾机枪手击落了其中１架Ｂｆ－１０９，但紧接着他的ＳＢ被直接命中，Markutsa上尉驾驶着着火的飞机迫降在野地里，全机３人中只有他１人生还，在接下来的５天里，他和苏第７４９步兵团的３１２名士兵经过苦战，终于回到了苏方战线，Markutsa因此被授予“苏联英雄”称号。
随着芬兰在６月２５日向苏联宣战，苏北方方面军的空军部队不得不在两个方向上作战，严重削弱了他们抵抗德军攻势的能力。在战争初期，苏波罗的海舰队所属海军航空军第１３战斗机团第４中队产生了两个富有传奇色彩的飞行员Aleksey Antoneko大尉和Petr Brinko 中尉。这个中队的任务是为汉科港口的苏联守军提供空中掩护。
Antoneko大尉是参加过哈勒欣河战役的老兵，在那里他取得了集体击落日机６架的战绩，在战争爆发时他正在爱沙尼亚首府塔林，２３日一架执行侦察任务的Ｊｕ－８８出现在苏军阵地上空，正在吃饭的Antoneko等不及带上头盔和降落伞就紧急起飞，他迅速击落了这架Ｊｕ－８８，这是苏波罗的海舰队海军航空军的第一个空战胜利记录，事后Antoneko若无其事地回到饭桌，继续喝他的汤。现在装备着Ｉ－１６和Ｉ－１５３的第１３战斗机团来到了汉科军港，在这里苏军主要和芬兰军队作战，７月３日Brinko中尉击落了１架芬兰Bristol Bulldog 战斗机，４日他又击落了１架Ｊｕ－８８，７月１４日Antoneko大尉和Brinko中尉双双被授予“苏联英雄”称号。
在波罗的海地区，德国第１航空军把它的部队迁移到了Daugavpils－riga地区，在第５４战斗机联队的支援下，德第１“兴登堡”轰炸机联队猛烈轰炸了苏军阵地，苏联空军的活动很少，第５４战斗机联队在７月３日一整天连一架苏联飞机也没遇上，但Friedrich Kohl少尉的Ｊｕ－８８就没那么幸运了，他的无线电员后来回忆到“我们受到了６架苏联战斗机的攻击，我们的左引擎被击中起火，Kohl少尉把飞机迫降在野地里，我及时躲进了麦田里，但苏军士兵抓住了其余３人，其中一个下士当场被俄国人吊死，我不知道Koho少尉和另一个下士的命运如何。”
７月４日０５００时，德第７６和７７轰炸机联队的Ｊｕ－８８在第５４战斗机联队的掩护下，向苏军在Idritsa和Opochka的机场发起攻击，第５４战斗机联队联队长Hannes Trautloft少校回忆：“我们对Opochka 机场的轰炸摧毁了在地面上的少量几架飞机，在Idritsa 机场上我们没能找到任何飞机，我们把炸弹投向了跑道，在整个过程中，我们只受到少量苏联战斗机的拦截，我们的战斗机击落了其中一架”。
在更北方，在对苏军Dno 机场的空袭中，德第２６攻击机联队的一架Ｂｆ－１１０被苏第２混合空军师地１５９战斗机团Aleksandr Lukyanov少尉的ＭｉＧ－３撞落。在同一场战斗中，德第５４“绿心”战斗机联队第４中队的Hans Philpp 中尉取得了他的第３１、３２和３３次空战胜利。
７月４日下午，苏北方方面军空军司令诺维科夫将军出动了大量轰炸机攻击德第４装甲集团，德国战斗机宣称击落了４６架苏联轰炸机，苏第４１轰炸机师第１０快速轰炸机团的Leonid Mikhailov大尉在他的ＳＢ被重创后，撞击了地面上一个德国坦克纵队。７月５日德北方集团军群前进到了Velikaya河，并在对岸建立了桥头堡，德军在３天里前进了２２５英里，苏军立刻发动了反击，但德军在第１、７６和７７轰炸机联队的支援下，成功地击退了苏军的反攻，德国空军宣称击毁了１４０辆苏联坦克，并于地面上击毁了１１２架苏联飞机，其付出的代价只有２架轰炸机而已。
同时德第５３“黑桃Ａ”战斗机联队第２大队和第５４“绿心”战斗机联队成功地击退了苏轰炸机群，并宣称击落了２１架苏轰炸机。其中第５４战斗机联队第３大队大队长Arnold Lignitz上尉、Max…Hellmuth Ostermann少尉和Hermann Leiste少尉各击落了３架。
在这天的空战中，Lignitz 上尉的大队遭遇了苏第１２战斗机团的Ｙａｋ－１，苏联空军上尉Pavel Tarasov 击落了２架Ｂｆ－１０９，接着他的飞机也被击中，于是他撞击了第３架Ｂｆ－１０９，Tarasov 幸运地跳伞生还，不久他重回战场，在他在１９４４年７月２９日因飞机失事身亡前，Tarasov 参加空战２３５次，个人击落敌机２２架，集体击落敌机３架。
苏军企图将德军阻止在旧国界的企图失败了，但德军企图切断苏军撤退的途径的目的也没有达到，虽然损失了大量兵力和武器装备，苏军主力仍得以逃过了被包围的危险。这时，德国第４装甲集团直冲列宁格勒，诺维科夫少将别无选择只能命令他的已受到重创的空军继续他们对德军的攻击。７月６日对德军攻击的７３架苏轰炸机只有很少几架得以生还，在这一天，德第５４“绿心”战斗机联队宣称以损失５架Ｂｆ－１０９的代价击落了５７架苏联飞机，其第９中队中队长Hans…ekkehard Bob 击落了３架第机，使他的击坠数达到了２９架。德第５４