南云海军中将这时完全肯定了应当对中途岛再度攻击。他觉得既然没有报告附近有敌人的水面兵力，便可以放心地行动了，所以，7点15分，也就是敌鱼雷机攻击刚刚结束之后，南云海军中将命令已经作好攻击敌舰准备的第二波飞机立即准备再次空袭中途岛。这就是说，“赤城号”和“加贺号”上已经装好鱼雷的水平轰炸机必须卸下全部鱼雷，换上炸弹（原编者按：只有“赤城号”和“加贸号”的飞机需要更换弹药。因为，上文提到过，在第二攻击波中，鱼雷机都足“赤城号”和“加贺号”的飞机，俯冲轰炸机都是“飞龙号”和“苍龙号”的飞机，在第一攻击波中，龟雷机（即水平轰炸机）都是“飞龙号”和“苍龙号”的飞机，俯冲轰炸机则都是“赤城号”和“加贺号”的飞机。）。已在飞行甲板上的水平轰炸机都一架架地送回到机库，再重新装上炸弹。飞行人员，地勤人员和军械人员拚命地从事着这一吃力的工作。
刚歇了一会儿，南云部队再次遭到攻击。快到8点的时候，“赤城号”了望哨报告，“飞龙号”遭到敌轰炸机攻击。“飞龙号”周围升起了一道道黑色水柱。接着“苍龙号”的四周也升起了水柱。但没有看到黑烟，说明它们都没有中弹。
我看了一下敌机识别图，发现攻击“苍龙号”的敌机是B—17。这是美国最新型陆军轰炸机，一共有十四架。读了战后美国资料后，我们才知道这十四架B—17轰炸机是在拂晓前从中途岛起飞的，本来是去攻击日本输送船团，但中途改变计划，攻击了日本航空母舰。每架飞机携带四吨多炸弹，在二万英尺高空投弹后，安全返回基地。他们的报告吹嘘说，两艘日本航空母舰中弹四颗。
我看到我们没有一架战斗机去追击敌机而感到很懊丧。不过我想起据报道这种飞机很坚实，我知道我方战斗机的二十毫米机关炮要把它们打下来反正也是很不容易的事。在这时候，这些“空中堡垒”在隆隆声中洋洋得意地飞走了。我们的高射炮集中火力向它们开火，但没有一炮命中。
就在大约这个时候，第二攻击波的0式机全部起飞，加强我空中战斗巡逻。8点正（据本书日文版第169页载，为7点55分。——译者），了望哨报告，自中途岛方向飞来一股小型敌机。担任警戒的前卫驱逐舰立即施放烟幕，同时向敌机开火。
这次，敌机攻击的方法令人莫明其妙，他们飞得太高，不适于进行鱼雷攻击，又低得不适于进行俯冲轰炸。敌机以小角度俯冲，飞向“飞龙号”。一共有十六架飞机，散开得很广。它们遭到十多架0式机猛烈攻击，一架接着一架栽到海里。即令有半数敌机被击落，其余敌机仍继续勇敢地逼近并最后投了炸弹，看来肯定会击中这艘航空母舰了。但等到炸弹硝烟消散后，“飞龙号”仍安全无恙，还是那样雄赳赳地继续航进。在这次攻击中，美国飞机没有象往常那样使用效率很高的超低空俯冲跳弹轰炸技术，这使我感到十分奇怪。
战后，美国关于这次轰炸的记述对此作了说明。原来，大约一小时以前，这十六架海军陆战队俯冲轰炸机（SBS）从中途岛起飞时，领队完全了解他的飞行员没有俯冲轰炸经验，所以在发现日本航空母舰后，决定采用下滑轰炸。有八架飞机没回到基地，返回到基地的有六架受伤报废。
到这时为止，我们遭到敌岸基飞机各种方式的攻击（鱼雷攻击、水平轰炸和俯冲轰炸），但我们仍然没有受到损失。老实讲，我认为，敌人飞行员的技术并不高明，南云海军中将和他的幕僚也是这样评价的。我们普遍认为，敌人的攻击技术不足惧。但说来奇怪，正是由于敌人的攻击直到此时没有取得任何成果，倒是大大有助于美国的最后胜利。我们忽略了采取一些明显必要的预防措施。如果采取了这些措施，也许能够避免几小时后发生的惨败。敌岸基飞机所作的看来是徒劳无益的牺牲到头来并非落空。
敌机下滑轰炸刚刚结束，我们的环形队形中较远的一艘驱逐舰就发出烟幕信号，报告发现更多的敌机。数了数差不多有一百架。驱逐舰立即向它们开火，但打了几炮后突然停了下来。原来，这些飞机是空袭中途岛后返航的第一攻击波。时间是8点30分。
由于敌机攻击时各舰各自进行规避活动，而且航空母舰在战斗机起飞和返航时频频移动，我们原来严整的航行队形大为散开，所以很需要利用战斗间隙收拢部队。但现在更迫切的是收回友永的飞机。我们这时有老练的飞行员，即令是在紧张的战斗情况下，在母舰上做到迅速收回也是轻而易举的事。从航空母舰转向顶风后只要花十五分钟时间，全舰配备的飞机就能以高超技术降落在甲板上。
收回飞机的工作毫不迟延地开始了。各航空母舰都下令：“清理飞行甲板，准备收回飞机！”“赤城号”开始了紧张的作业。在“加油干”的口号鼓动下，毫无怨言的地勤人员开始以极大的劲头清理着飞行甲板。几分钟后，“赤城号”飞行甲板已清理完毕，8点37分，信号桅上升起了一面信号旗：“开始降落！”返航的飞机迅速地相继降落在飞行甲板上。9点过后不久，四艘航空母舰全部收回了自己的飞机。
三架被击伤的鱼雷机降落前在“飞龙号”上空盘旋一周。指挥“飞龙号”上收机作业的“飞龙号”飞行长川口益海军少佐，立即把军医官换到指挥所。有一架飞机在降落时只剩下一个机轮。这架飞机的驾驶员角野博治海军大尉在飞机颠簸降下后，立即昏厥。敌战斗机在目标附近进攻我飞行队伍时，仙被敌机的机关炮弹打伤了绁。但他仍然忍痛同其他飞机一道飞行，参加了空袭，并返回了航空母舰。
友永海军大尉飞机的左机翼油箱中弹，他也驾机返回了航空母舰。友永海军大尉报告说，“飞龙号”的鱼雷机队菊池六郎海军大尉殉国。菊池的飞机在中途岛上空不幸被高射炮火击中，他打开座呛盖，向战友招手诀别，然后毅然关上舱盖，与飞机一块坠到地面上。
五、发现敌航空母舰
在空袭中途岛的友永机队返回航空母舰一小时以前，南云海军中将面临的战斗形势发生了彻底改变。7点20分，推迟半小时起飞的“利根号”第四号搜索机以一百度航向飞抵远达三百海里的搜索扇面终点，它在进行回程搜索前，先转向向北搜索六十海里的时候，于7点28分突然发现左方大约有十艘军舰驶往南东。这架飞机还来不及飞近去观察，就立即向南云部队报告：“发现十艘军舰，好象是敌舰。方位10°（以中途岛为基准的方位，下同。——译者），距离中途岛240海里。航向150°，航速20节以上，时间7点28分。”
这份极其重要的电报因经由“利根号”转发，旗舰“赤城号”收到时稍晚了几分钟（原编者按：文件表明，收报时间是有矛盾和不准确的。南云部队的官方报告在概述这次作战时说，“大约在5点”（中途岛时间8点）收到了这份电报。这个时间从该报告提到的详细作战日志的记载上看，显然是不准确的。作战日志肯定南云将军紧接着在7点45分和7点47分向部队连续发出了命令，这说明在此之前收到“利根号”搜索机的报告。作战日志还提到“利根号”飞机发来的其他电报，并注明了发报和收报时间，其中多数电报的收报和发报的时间是相同的，少数电报稍晚一点，但也不超过十分钟，这显然是因转发而迟到的。（见《第一航空舰队1942年6月15日第六号作战详细报告》第6页，第28…32页，也可见于美国海军情报局出版物OPNAVP32…1002号关于上述报告英译本《中途岛海战日本纪实》第7页，第13…16页。））。“赤城号”舰桥上的南云海军中将和他的幕僚收到这份电报时犹如晴天霹雳。直到这时为止，没有人预料到敌人的水面部队竞可能出现得这么快，更没有人预料到敌人的军舰就在附近待机伏击我们。现在，整个形势发生了变化。
情报参谋小野海军大尉立刻在海图上查明了敌舰位置，估量了敌我距离，敌人离我们恰好二百海里！就是说，敌人处于我飞机的攻击圈内，但是，如果敌部队中有航空母舰的话，我们也处于敌攻击圈内。现在的重要问题是：敌军的组成如何？是否有航空母舰？
搜索飞机报告完全没有说敌军究竟包括哪些兵力。这使南云海军中将、草鹿参谋长和参谋们既担心，又恼火。“十艘军舰，好象是敌舰”，说得很不清楚。显然，这些军舰只能是敌舰，但包括哪些舰种呢？
7点47分，“赤城号”发电严令“利根号”搜索机：“查明舰种并保持接触。”
由于发现敌水面部队，两分钟以前，南云海军中将已经采取另一行动。为了准备第二次空袭中途岛，从？点15分开始，“赤城号”和“加贺号”原留在第二攻击波的鱼雷机队匆忙卸掉鱼雷，换上八百公斤炸弹。到这时，换装弹药的作业已经完成大半了，可是现在，迫切需要做好准备，以便万一“利根号”飞机再来报告证实了敌舰队对南云部队是真正的威胁时，好迎击它们。所以，7点45分，南云海军中将命令这两艘航空母舰立即停止弹药换装工作，并命令整个部队准备攻击敌舰。
7点58分，“利根号”的搜索机报告，敌舰改变航向，现在的航向为080°，但仍未报告舰种。对此，南云的参谋们急得发火。8点正，“赤城号”命令“利根号”搜索机立即报什敌舰队兵力组成情况。
最后在8点9分，答复来了：“敌舰为五艘巡洋舰和五艘驱逐舰。”
小野情报参谋洋洋得意地说：“跟我想的一样，没有航空母舰。”随手把电报递给了草鹿参谋长。草鹿参谋长的反应是，如果敌舰队中没有航空母舰，南云部队可以放心稍后去收拾它们，现在首先应该歼灭中途岛上的敌航空兵力。但8点9分的消息所带来的宽慰没能维持多久。8点20分，“利根号”的搜索机又报告说：“敌舰队殴后好象有一艘航空母舰。”
这个报告使“赤城号”舰桥上的每一个人都紧张起来。但是，因为说的是“好象”，大家仍然半信半疑。情况还没有确切辨明。乐观的人这样推论：如果敌舰队确实包括航空母舰，敌舰载机怎么不来攻击南云部队呢？
8点30分，又收到“利很号”飞机的报告：“敌舰队中尚有另二艘军舰，显然是巡洋舰。方位008°，距离中途岛250海里，航向150°，航速20节。”
根据敌兵力的规模，南云海军中将断定，敌兵力中至少有一艘航空母舰，所以，他决定在第二次空袭中途岛以前，必须首先攻击这些敌舰。可是，要立即攻击敌人，还有严重障碍。7点45分，南云海军中将下令停止换装弹药时，“赤城号”和“加贺号”的大部分鱼雷机都已经装上了炸弹。另外：为了加强战斗巡逻，防备敌岸基飞机攻击，第二攻击波制空队的全部0式战斗机都已起飞。因此，真正装好弹药、可用于进攻敌舰并已排在飞行甲板上准备起飞的飞机只有“飞龙号”和“苍龙号”的三十六架俯冲轰炸机了。
南云海军中将确实处于进退维谷的境地。如果他派出俯冲轰炸机对敌特混舰队施以先发制人的攻击，它们没有战斗机掩护，可能遭到严重损失。还有，要不要使用停在“赤城号”和“加贺号”飞行甲板上的那些已经卸下鱼雷和装上八百公斤炸弹的鱼雷机（原编者按：已经完成弹药换装作业的鱼雷机又重新被推到两艘航空母舰的飞行甲板上，显然，就留在那里；同时，其它鱼雷机的换装弹药的工作停止进行。那些还没有卸掉鱼雷换上炸弹的鱼雷帆，显然是田在下面的机库里。），也是一个问题。对于舰船目标来说，炸弹的效果虽不如鱼雷，但如果能直接命中，仍能使敌舰受到重大损失。但是，鱼雷轰炸机比俯冲轰炸机更需要战斗机掩护。要投弹效果好，它们得保持直线和平面飞行，这样就没有可能进行闪避的活动。如果没有护航队的掩护，它们很容易成为灵活的敌战斗机的活靶子。
南云海军中将考虑他应该怎么办好；友永的飞机空袭中途岛归来，这使迅速作出决策更为迫叨。有些飞机已经遭难，而护航的战斗机的汽油也快耗尽了。必须赶快收回友永的飞机，否则还会有更多损失。或者是立即让俯冲轰炸机和鱼雷机起飞，在没有战斗机掩护下去攻击敌人，以便腾出飞行甲板。再不，就把这些飞机挪开，好让友永的飞机降落，但这样就可能耽误发动进攻的口寸刻。
就在这时候，勇猛的第二航空母舰战队司令官山口海军少将向南云海军中将提出一项紧急建议。山口的旗舰“飞龙号”离“赤城号