。而且，由于木材缺乏，船只和今后在贫瘠的埃及所用燃料都将是个问题。
最主要的问题，也是成败的关键问题是——如同布吕埃斯提出的那样——法国海军缺乏训练的问题。逃亡、低廉的军饷、恶劣的条件、死亡的威胁和不合格、不守军纪的新水兵和军官，使法国海军形同虚设。军官并不比怕死的水兵可靠，士气低落的海军是全军的害群之马，这使得新上任的海军中将布吕埃斯伤透脑筋。他需要足够的战船、水兵和军官，否则如何能够像拿破仑所建议的那样同时进攻印度、埃及和英国？即使为埃及远征军征集1；000万到1；500万法郎（最高数额未曾透露过）已经是一场噩梦了，而按照拿破仑的作战计划则需要5；000万法郎，这简直是个无法企及的天文数字。和平协定切断了法国国库的财路，虽然从被占的荷兰、比利时、瑞士和意大利的战利品源源不断运往法国，法国国库仍然濒临破产，由于和平协定的签订，法国断了战利品和“战争贡献”这两个财源。此外，拿破仑在他的计划中还忽略了一个重要的因素，那就是时间。
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第五章决定（4）
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早在3月份，拿破仑第一次提出远征埃及的计划，正是考虑到进攻英国“在数年内”是不可能的，因为需要时间造船和组建新海军。但是，一个月后，他却谈论起要在1798年11月发动一场更大规模的战争。仅造船所需要的木材、麻和帆布等其他材料的订购就需要数月时间，此后可能需要数年的时间才能造好；即使从最快的情况考虑，使用最大的资金，执行拿破仑的计划也需要两年到两年半的时间。但是，他却白日做梦般地建议在7个月内发动这场战争。
拿破仑的这个梦自然没有成为现实。不幸的是，蒙日当时没有能够研究他的这个最新的建议，实干的贝尔蒂埃也没有。尽管如此，这项伟大幻想的计划向督政府证明了拿破仑将军有着令人害怕的天才头脑，能够应付一项错综复杂的全球性的战略问题。虽说他的计划是不可行的，但却是出自一个非同凡响的人的计划，这个人将来可以干出任何他们所期待的事，也可以干出令他们害怕的事——他很快就要出征地中海另一边的遥远国度，谢天谢地，这真是令督政府松了一口气。
1798年春，已经被远征事务缠身的拿破仑又遇到一件先令他奇怪后来差点使他气昏的事情。3月，一名因与约瑟芬不和而被她解雇的使女路易·科姆波茵向他指控他的妻子与一名叫伊波利特·夏尔③的年轻英俊的军官私通，这个夏尔就是在意大利战役中陪同约瑟芬奔赴米兰的夏尔中尉。这名使女同时揭发他们还染指非法投资和投机活动。拿破仑深知下人的报复心和不诚实，下令大多数都是反对约瑟芬的波拿巴家族成员（包括哥哥约瑟夫）就此事进行调查。经过调查，3月9日，约瑟夫会见拿破仑并向他报告了调查结果，不仅证实了听到的一切，而且还有更多。
约瑟芬于1796年与夏尔中尉初次相遇后便一见钟情，频繁往来。1796年～1797年的意大利战役期间，由于拿破仑或是其他人员的在场，使得这对恋人的私情受到障碍，但是，在坎波福米奥和约签订之后，就在他们回法国之前，两人在威尼斯找到了肆意放荡的机会。后来，当拿破仑在前往拉什塔特的路上时，约瑟芬和夏尔又得以有机会一起乘坐她的马车（用拿破仑的钱）旅行，花了数周时间翻越阿尔卑斯山，在马车越过国境时夏尔才与她分手。当妻子于1798年1月2日抵达巴黎时，已是数周之后的事，拿破仑虽然非常恼怒，但对于中尉竟敢与他平分秋色之事尚蒙在鼓里。还有，本身也染指各种投机活动和暗箱交易的约瑟夫告诉他的弟弟：约瑟芬、夏尔伙同巴拉斯和其他官员在专门与意大利军从事战争交易和欺诈的波丁公司投资，数额巨大，还涉嫌买卖国家财产，特别是北方被占领土的地产包括修道院等。
拿破仑召见约瑟芬，和约瑟夫一起向她摊了牌。她痛哭流涕，声称这一切都是不实之词。“是啊，我的伊波利特，”事后她立即给她的恋人通风报信，“我恨他们所有的人。你，只有你能得到我的爱和温情的思念。真应该让他们知道我有多么憎恶他们……让他们知道不能如我所愿地经常见到你，我是多么后悔和失望……喔！我对这些怪物都干了些什么，使他们这样对待我？”她甚至提出了和拿破仑离婚的打算，但受到夏尔及时的制止。拿破仑和约瑟夫知道了她的不贞和放荡，但缺乏来往信件等真凭实据，只能警告她：如果再和夏尔在他的公寓或波丁公司的办公室里私下来往，或是再介入波丁公司的投机生意，她将承担后果。
约瑟芬藐视所有的人，不但继续和伊波利特·夏尔公然约会（他现在已经退役回家专门从事兴旺的买卖），而且变本加厉地在波丁公司搞投机生意。与此同时，拿破仑情绪显然得到缓和，接受了约瑟芬的否认，告诫她今后好自为之，一周之后还为她在凯旋街买下了一栋豪宅。拿破仑日夜操劳各种政治和军事计划，既没有时间也没有心情过问约瑟芬的贞操之事。可是那个夏天，当他远离法国海岸之后，拿破仑被告知约瑟芬与夏尔的私通已经达到了他想像不到的登峰造极的地步。
此时远征军已经万事俱备。虽说拿破仑原计划的4月9日出征日期已经过去，但至少他的军事指挥团已经组成，包括土伦的克莱贝尔、马赛的雷尼尔、契维塔韦基亚的德塞、阿雅克肖的沃比翁和热那亚的梅纳尔，由多马丁指挥炮兵、迪马指挥骑兵、卡弗雷里指挥工程兵。4月17日，拿破仑命令布吕埃斯准备于4月27日启程。但是，一个突发事件耽误了预定的行程。
4月22日，埃及远征军的出发日期已经临近。拿破仑已经做好了一切准备，这次，他要求一定按照预定的计划行动。他从巴黎通知布吕埃斯：“我定于明天晚上动身来土伦。我希望在我到达时能够看到舰队已经准备好起航。”这是一份直率而急躁的文书；他将不再容忍任何借口。无论是否准备就绪，舰队务必在5天之内出发。但是，拿破仑的生活中经常出现难以意料的事情——现在就发生了。
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第五章决定（5）
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4月23日，信使从维也纳传来的消息使拿破仑无法动身离开法国首都。消息说4月13日，刚吃了败仗的奥地利人将贝纳多特公使所在的大使馆门前的法国国旗扯了下来，撕成了碎片，这面旗帜是1796年贝纳多特公使按照督政府的命令在法国大使馆门前升起的。这个愚蠢的行动是由冲动的维也纳爱国者干的，但贝纳多特没有别的选择，只能关闭大使馆并离开哈布斯堡以示抗议。
巴黎对此事的反应强烈。督政府立即下令从海峡地区向奥地利边境调兵。战争阴云笼罩欧洲，卢森堡宫内的特使来往穿梭。拿破仑命令他的机要秘书布列纳推迟动身日期。卢森堡宫紧急召见拿破仑共同协商对策，并命令他留在巴黎待命。
次日，一名奥地利王国外交特使从维也纳赶赴巴黎，带来了奥地利政府的正式道歉。督政府为此松了一口气，因为，他们最不愿意看到的就是欧洲在这个时候重新开战。同日，督政府再次召见拿破仑，通知他“准备立即动身前往拉什塔特与奥地利政府协商……以便解决两国之间的一切问题”，包括诸如法国干预罗马（法国人在罗马逮捕了教皇并成立了罗马共和国）、那不勒斯、托斯卡纳和瑞士问题。于是，拿破仑“全力以赴进行谈判和签订协议的工作”。
对于拿破仑来说，这是一个天赐良机，如果他能成功谈判并签订一项包罗万象的国际条约，他将名声大振。奥地利人最害怕的就是这位个子矮小的科西嘉人，而督政府里的塔列朗和巴拉斯正是要利用这一点使他们能够获得最大利益。在这种情况下，拿破仑自然暂时将埃及远征之事搁在一旁。尽管如此，拿破仑并没有放弃他的埃及远征计划，而是告诉土伦的克莱贝尔——远征只是推迟数日而已。与此同时，他委托克莱贝尔临时代替他全权指挥，继续备战，随时待命出发。他给布吕埃斯寄去一份简短的说明之后便集中精力于他的新目标。
有外交部长塔列朗的全力支持，有他军事生涯的发端人、现在仍是督政府中举足轻重的人物巴拉斯作为后台，拿破仑自然有恃无恐、满怀热情地来回奔波于外交部和卢森堡宫之间，并致信奥地利高级外交官，称他不久即将前往拉什塔特，由于维也纳的致歉，他预计两国之间的问题能够得以和平解决。与此同时，法国继续向奥地利边境调兵遣将，使奥地利处于大兵压境的境地。
不幸的是，拿破仑的身边缺乏可以给他忠告的人。显然，外交部长塔列朗无法制约这位科西嘉将军的虚张声势的要求。结果，在一次与巴拉斯私人会晤的情况下，拿破仑秘密地夸耀他有可能放弃埃及远征，但是，他没有向巴拉斯和塔列朗透露有关他个人目的和热望的任何想法。5月初，拿破仑向督政府公开了他的所有想法，他锋芒毕露、气势逼人地大谈如何利用奥地利的弱点在谈判桌上与他们讨价还价，以迫使他们割让更多的土地。作为对他的奖励，督政府里应该有他一把交椅（受到惊吓的巴拉斯早先就提出过28岁的拿破仑还不符合进督政府的法定年龄，即至少40岁）。督政们自然对他的权势欲大为震惊，更不用说他的目中无人和桀骜不驯了。他们需要和平，不能让拿破仑·波拿巴为所欲为。
作为整个经过的目击者，巴拉斯认为拿破仑想在拉什塔特以法国的强大为筹码将自己的意志强加于无望的牺牲者，“拿破仑不愿坐失如此大好良机”，而且“企图通过督政府独断所有欧洲事务，他不再掩饰对督政府的蔑视”，并且“以退出军界对我们进行威胁”。憎恶这个傲慢将军的督政勒贝尔立即拿出纸和笔——“将军公民，签字！”因自己这次的过分言行而受到羞辱的拿破仑，以“完全的沉默对此加以断然拒绝”。
这次会见后，督政府五人执政团再次开会讨论，取消了拿破仑的外交使命和拉什塔特之行，然后令巴拉斯亲自将该决定通知拿破仑本人。
当巴拉斯到达拿破仑在凯旋街的住所时，发现他的仆役正在朝马车上搬箱子，拿破仑正在打算动身去拉什塔特！他们的会晤只进行了15分钟，根据布列纳的回忆，他们两个人关在拿破仑的小书房里，巴拉斯要求拿破仑交出现在已经失效了的外交护照。“巴拉斯首先离开，穿过客厅，没有和拿破仑夫人打招呼。将军接着出来，将巴拉斯送到门口。然后，一言不发地回到他的书房，将门‘砰’的一声关上了。”
拿破仑对布吕埃斯口授了一封简函，命令他5月9日将部队装船，同时，告诉他的老朋友卡弗雷里将军：埃及远征将继续进行，他将于次日晚上动身到土伦去。
拿破仑在法国最有权势的5个人面前蒙受的羞辱是他既不会宽恕也不会忘记的，他决心要他们为此付出代价。“他们完全不需要我了，”他对布列纳透露道，就像原来在布里埃纳军校时那样，“必须推翻他们……但是，时机尚不成熟……我还需等待……我将完全靠我自己了。也好，我们终于要去埃及了，那里有着获得荣誉的全部伟大机会……我将去获取荣誉。”
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第五章决定（6）
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5月3日，拿破仑将军和约瑟芬以及布列纳一道离开了巴黎。匆忙之中，他竟未能注意到《箴言报》上刊登的一则公告，说的是一个战俘，名叫威廉·西德尼·史密斯的年轻的英国海军上校，靠拿破仑在皇家军校的同学路易·德菲利波的帮助越狱逃跑之事——有朝一日，这两个人都会在遥远的阿克海港与拿破仑狭路相逢。
在赴土伦的5天旅途中，拿破仑一言不发地沉思着。但是，当他于5月9日早上6点钟到达土伦时，他已经是个完全不同的人了；最后的决心已定，现在就要促使其变为现实：他决定成功，去获取荣誉！
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第六章海军舰队（1）
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上千英里旅途、将近6天的车马颠簸，拿破仑将军已经疲惫不堪了，可是他却毫无倦容。抵达土伦后，他既没有休息，也没有在专门为他准备的、俯视熙熙攘攘的土伦港的石头宅子里陪伴约瑟芬或听布列纳汇报，而是立即视察准备登船的军队。他对待自己就像对待他的下属一样毫不留情；他对待军事视察和对待生活中的其他事情一样一丝不苟、严肃认真；他亲自检查士兵的战备状态，检查他们的枪支、刺刀、装备、大炮、由6匹～12匹马拉的两轮炮车以及弹药车等等。
拿