干事的合适人选；她的参选不是一个人的事情，而是香港特区政府以至整个国家的大事。
国务院副总理吴仪、国务委员唐家璇和外交部长李肇星在竞选前都亲自接见过陈冯富珍，卫生部部长高强还亲率代表团赴日内瓦，为陈冯富珍竞选助阵。
2006年8月2日，竞逐世界卫生组织总干事的陈冯富珍赴日内瓦全力开展竞选活动。陈冯富珍表示，如果她当选，她的服务对象是全球人民，并称世界卫生组织总干事要公平、公正、不偏不倚。
9月6日，世界卫生组织公布了参加竞选新一任总干事的候选人提名名单，其中包括中国提名的香港特别行政区前卫生署署长、世界卫生组织现任助理总干事陈冯富珍。
这次参选人共有5名候选人曾任世界卫生组织官员。除陈冯富珍外，还有日本候选人尾身茂、芬兰代表普什卡、土耳其代表荼萌、墨西哥代表胡里奥。
按照世界卫生组织组织总干事的选举规程，执委会11月7日将对这5名候选人进行面试，随后执委会将在8日选举出唯一的候选人，并将其提交9日召开的组织大会审议并批准。
经过4轮投票的激烈竞争，中国推荐的陈冯富珍击败其他4名候选人，当选世界卫生组织总干事唯一候选人。
11月9日，世界卫生大会特别会议在日内瓦万国宫会议厅举行，对执行委员会的提名进行考虑和表决，表决以秘密投票进行。表决前，被提名人将在会议上发表演说。
日内瓦当地时间9日，陈冯富珍在有世界卫生组织193个成员代表参加的大会上发言，阐述了自己当选的感受和世界卫生组织今后的工作重点。
陈冯富珍说，世界卫生组织取得卫生领域的成果需要处理六个核心问题。
这六个核心问题是：卫生的发展、健康的安全、卫生的能力、卫生的信息和知识、卫生的合作、健康的绩效。前两个问题是关系到人类最基本需求的问题。贫困和不安全是和谐面临的两个最大的威胁，“和谐”一词是世界卫生组织章程的核心。和谐是文明的尺度。健康与发展和安全密不可分，同样密切关系到人类和谐。第三和第四个问题是两个战略性问题，包括能力建设——特别是加强卫生体系。这意味着获得确凿证据和确定研究和发展议程。最后两个问题是行动问题：处理伙伴关系和改进世界卫生组织工作。
陈冯富珍表示，像所有前任总干事一样，她需要处理世界卫生组织三个主要方面的问题，即技术问题、管理问题和政治问题。她决心在促进卫生事业方面取得重要的实际成果。
陈冯富珍表示，将致力于实现世卫组织《组织法》中载明的崇高而历久弥新的目标：“各民族企达卫生之最高可能水准”。
她坚信：“我们面前的卫生挑战非常严峻；但我们依然感到乐观。世界卫生组织具有为全世界造福的使命、经验和职能。如果在强有力的领导下充分发挥这些正面作用；世界卫生组织就能取得令人瞩目的卫生成就。”
2006年11月9日，世界卫生大会正式确认陈冯富珍为新一任世界卫生组织总干事。
根据程序，经过世界卫生组织大会任命后，陈冯富珍将正式上任。这是中国第一次推荐人选参加联合国高层机构负责人选举，也是首次有中国人担任世卫组织总干事。
得悉这一消息后，正在比利时布鲁塞尔访问的香港特区行政长官曾荫权立即致电陈冯富珍表示祝贺。
曾荫权表示，对陈冯富珍当选世界卫生组织新任总干事，感到十分高兴。陈冯富珍能够当上联合国辖下组织的主管，是国家和香港的光荣。
香港特区政务司司长许仕仁表示，陈冯富珍当选后任重道远，她将要带领世界卫生组织面对传染病等各种问题，需要不偏不倚、很专业的精神，相信她有能力把工作做好。
中央人民政府驻香港联络办公室主任高祀仁代表中联办向陈冯富珍以高票当选表示热烈的祝贺。他表示，陈冯富珍可以当选，反映中央对香港的重视、信任，对港人的信任。希望有更多的香港精英能够在中央政府的支持下更多地参与国际事务。
中国外交部发言人姜瑜表示，陈冯富珍女士当选世卫组织总干事唯一候选人，是世界卫生组织执委会民主选举的结果。
国家卫生部长高强表示，希望陈冯富珍做一个公正的总干事，并欢迎陈冯富珍随时就中国的公共卫生提出批评和改善建议。高强说：“如果我们有什么不足，我欢迎她提出批评，如果我们有什么经验，也欢迎通过世界卫生组织和其他发展中国家共享。”
陈冯富珍以高票当选世界卫生组织总干事，香港各界倍感鼓舞，认为这是香港人的光荣。
11月9日，当选世卫组织总干事的陈冯富珍在返回中国的前夕，接受记者专访时说：“中国与世卫组织合作良好，及时与世卫组织交换信息，为世卫组织的工作提供了方便。中国是个大国，其公共卫生的状况他国都很关注，中国在公共卫生领域的合作态度积极。”
世界卫生组织驻华代表贝汉卫向陈冯富珍表示祝贺，并赞扬她活力充沛，热诚，经常保持笑容。他说相信对日后跟各国分享卫生管理经验，大有帮助。
世界卫生组织安全社区推广协进中心主席温思朗表示，陈冯富珍声誉良好，是优秀的专家。
世界卫生组织精神健康及滥用药物主管表示，陈冯富珍是首名出任此职的女性，对推动女性事务工作，相信有正面影响。
日本参选人尾身茂表示，跟陈冯富珍是好朋友，落选也不会难过，未来会返回世界卫生组织，续任西太平洋区总监，跟陈冯富珍合作。
根据世界卫生组织规定，陈冯富珍将于2007年1月4日正式履新，任期5年半。至2012年6月30日结束。而她的除税后年薪，是15。4万美元，即约120多万港元，另加2万美元的社交津贴。
2006年11月28日，中国国务院总理温家宝在北京人民大会堂会见世界卫生组织候任总干事陈冯富珍。
2006年12月16日，世界卫生组织候任总干事陈冯富珍前往华盛顿总统府参加美国总统夫人主持的白宫疟疾高峰会，研商如何推动及改善非洲疟疾问题。根据世界卫生组织的统计，非洲地区平均每30秒就有一名儿童死于疟疾，若能给非洲民众提供每顶不到10美元的蚊帐，即可大大减少疟疾死亡病例。美国总统布什2005年曾倡议以5年时间拨12亿美元，在非洲15个国家推动防止疟疾计划，将使得罹患疟疾的人数减少50％。
2006年12月17日，候任世界卫生组织总干事陈冯富珍在联合国总部拜会联合国秘书长安南，就当前世界卫生组织功能及全球卫生环境交换意见。
这是陈冯富珍当选后首次拜会联合国。
陈冯富珍强调，上任后将积极推动与改善非洲及全球女性两大族群的健康，以此作为衡量世界卫生组织的工作成效。
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安南对此表示赞同及欣慰。
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陈冯富珍简历
陈冯富珍出生于香港，拥有加拿大、英国、新加坡等多个国家的学历。她从1978年开始在香港政府任职，1994开始任香港卫生署署长。2003年在抗击“非典”疫情中，陈冯富珍为更多的人所认识和肯定。其后她辞去香港卫生署署长一职，出任世界卫生组织助理总干事，专责应对禽流感工作。
在世界卫生组织工作的3年时间里，陈冯富珍在推动各国制定防范禽流感应变计划、发展免疫科研技术等方面取得显著成绩。她对于当前全球卫生事业面临的挑战与机遇有深刻认识和独到见解，对世界卫生组织的未来发展有系统而成熟的考虑，其丰富的专业知识和出色的工作能力得到了业界普遍肯定。
2006年11月9日，陈冯富珍以高票当选为世界卫生组织总干事。
世界卫生组织
世界卫生组织（WHO，简称“世卫组织”），是联合国下属的一个专门组织，成立于1948年4月7日，总部设在瑞士日内瓦。
世界卫生组织现有193个会员国，在全球各地合共约有3500名卫生和其他专家及支持人员，在日内瓦总部、6个区域办事处和国家工作。其日常工作由执行委员会负责。
世界卫生组织执委会是世界卫生大会的执行机构，负责执行大会的决议、政策和委托的任务。它由有资格的卫生领域的技术专家组成，每位成员均由其所在的成员国选派，由世界卫生大会批准，任期3年。
世界卫生大会是世卫组织的最高权力机构，每年召开一次。主要任务是审议总干事的工作报告，规划预算，接纳新会员国和讨论其他重要议题。世界卫生组织由会员国通过世界卫生大会进行管理。
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