一万人左右，信长对横山城保持包围状态。按照常识，在敌方大规模后援出现的时候，应当全军集结，做迎击的准备，而信长却根本无视战争的规则。
合战兵力分配图
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当时的织田·；德川势，就像桶狭间时的今川势一样分散看来，而且本阵置于最前线的突出部，背向着朝仓·；浅井势。普通情况下，在一般围攻战中的本阵，应当配置在接近自军的支配领域的场所如桶狭间的今川义元就是将本阵置于离最前线很远的后方一座称为“あけはざま山（血红狭间）”的山上。在横山城这样的场合，本阵应当设立在接近美浓的东南侧视野开阔的高地上。但是在信长看来，开阔的视野要比安全性更优先，并将本阵设在了横山城北侧的半岛上平地的突出部——龙鼻。这个位置能够清楚地监视小谷山周边的敌情，同时信长的主力部队全部被配置在横山城的四周，呈分散的状态。虽然设置了境界用的监视哨，在如此接近敌军的场所设置本阵，说明信长依然在向朝仓·；浅井势挑战，将其诱出决战的意图非常明显。虽然要优先解决横山城的包围问题，朝仓·；浅井势却无法无视这个情况，无法抵抗与信长决战的诱惑。
另一方面，虽然知道这是一个陷阱，但信长布阵的缺陷所给予的如此好的机会决不能就这样放掉。经过商量，景健与长政决定抛下诱饵。
6月27日早晨，在大依山着阵的朝仓·；浅井势，从山麓的北国肋往还下山，将阵型改为准备移动的状态。据《信长公记》记载，织田势将这一举动误认为撤退的前兆。之后，织田势方面看到朝仓、浅井势从山的反面下山，加上前次的消极举动，织田势当然地认为敌人在撤退，而加强了横山城方面的攻击。
但是，在第二天，即28日天亮前，确认信长判断错误之后，浅井势从野村方向、朝仓势从三田村方向，向织田势发动了突击。在发现这一情况之后，织田势急忙派遣母衣武者召集正在围攻横山城的柴田胜家、佐久间信盛等诸将。通常所说的织田势的战斗准备是在27日夜间完成的，但是根据《信长公记》中28日天亮前的情况的描写，织田军中大半部队的实际战斗准备时间，应当是在通常确定的合战开始时间——凌晨五时之后，而且织田势的不少部队还在战场的后方移动中。当时，根据记述，织田势的大部分主力部队还位于横山城周边，正在进行包围战，距野战战场相当远。信长没有想到事态会突然变得如此严重，没有按他预想的方案发展，连队伍之间的呼应也变得困难起来。由于部队距离过远，很多部队几乎不可能一时之间夜间行军3—4公里后再保持战斗队型。当然，信长当时的布阵也不是没有考虑到敌军的攻击，但也是简单地让美浓三人众、马回众和德川势从东到西依次封锁渡河点，按照通常的说法，这是信长对自己兵力的优势相当自信的原因。
7、与通说不同的信长军的阵型
在信长合战之后，细川藤孝的书状中，有“此方より切り悬け”的记述。为了封锁渡河点，信长的直属部队从姊川一线开始前进，并将本阵转移至龙鼻。不可否认，合战是从朝仓·；浅井势完美的奇袭开始的。但在这一点上，也突显出了信长的能力，能够将序盘的劣势扳回是相当不易的。
最先行动的是朝仓势，以越前中南部的内众、国众为先头部队的8000多人，从三田村东南部越过姊川。突袭在冈山前面着阵的德川势。相对的，德川势的先头部队，是酒井忠次率领的东三河众。深知对方握有优势的忠次，沉着地指挥防御，抵抗杀到的朝仓势，在川中展开一进一退的激战。
看到这个情况的浅井势，也以猛将矶野员昌为先锋，强渡姊川，攻击坂井政尚、池田恒兴、森可成三将担任实际指挥的信长马回众。
按照通常的说法，当时织田势的布阵相当奇怪，不合常理。在甫庵的《信长记》及日本参谋本部编纂的《姊川の役》中登场的，通过对姊川合战的描述所绘制的有名的信长的布阵图，就是下面的这幅。但当时由于信长的部队大多还在从横山城向战场移动的途中，并没有可以形成极端纵深的阵型所需要的兵力。按照通常的说法，织田势是以坂井政尚、池田恒兴、木下秀吉、柴田胜家、森可成、佐久间信盛的顺序按纵向布阵的。但是根据实际的各武将战斗开始的顺序考虑，阵型的序列应当发生误差，在这里要解释一下。
在六将中，第一队的坂井政尚与第二队的池田恒兴、第五队的森可成从21日以来，一直作为信长的马回众参战。因此可以考证，三将所指挥的马回众，直接形成了对抗野村方向的浅井势的第一线到第三线，展开成为主战场。在战役开始时，马回众的右侧、龙鼻的北面，美浓三人众将队型展开，防备浅井势的迂回攻击。
以上的六队与信长的本队的警卫要员，就是战斗开始时信长手中的所有参战兵力。而且，在第三队木下秀吉、第四队柴田胜家、第六队佐久间信盛及监视横山城的丹羽长秀等总数达到一万余人的兵力到达战场之前，信长必须仅仅依靠马回众与右翼的美浓三人众、左翼的德川势，抵挡住朝仓·；浅井势的猛攻，苦苦支撑。
另一方面，在织田势的主力部队奋力赶往主战场的同时，朝仓景健和浅井长政也在进行着自己的战术构想。根据当时的战况和战斗方向，可以考证当时朝仓·；浅井势的目标，是直接击破信长的本阵及直属部队，进而讨取信长的首级。但是，击破信长的直属部队是一个有相当难度，实现可能性不高的目标，必须在信长的主力部队到达前完成。当时景健与长政的战略构想的第一步，是以两倍以上的兵力击溃缺乏主力的德川势。根据当时的作战常识，在实战上的以联军的主力朝仓势，扣击应当战意低下的德川势。
在战斗开始时，德川势的总兵力大约为3000人左右，同时织田势方面则有信长的马回众和美浓三人众合计8000人左右。作为主力的朝仓势，在兵力方面并不占优势。但是在当时的场合，对敌打击的效率更为重要，找出敌人的弱点，集中大规模的部队加以攻击，一般而言可以在非常短的时间内给予敌人相当大的损害。以压倒性的兵力对局部的敌人施以压倒性的攻击，可以达到使敌人混乱的目的。
同时，浅井势方面，作为战术的呼应，对织田势发动攻击，以牵制织田势的主力。只要在此期间全力攻击德川势的朝仓势，可以迅速地粉碎德川势，则与浅井势交战的织田势的侧面将受到狭击而崩溃，浅井·；朝仓势可以乘机将其一举包围歼灭。这是浅井·；朝仓势战略的第二步。
在浅井·；朝仓势的构想中，远国而来的德川势，在最近织田势接连的败局下，战意理应只有普通的状况，德川势的战意低下，是绝对可能出现的情况，而浅朝联军的战略构想，也是首先基于此的。在这种场合下，将缺乏战意的德川势击破后，人数占劣势的织田势必然导致总崩溃。浅朝联军可以简单地追讨对方崩溃的兵力，当然的，讨取信长首级的机会，自然也大大地增加了。
朝仓·；浅井势作出如此的战略构想，还有另外一个原因，就是无论是景健还是长政，都缺乏与信长直接对决获胜的经历。而且，无论是朝仓势还是浅井势，在他们当时的水平上，打胜仗多数是依靠军势占优。在朝浅联军中，与信长势相比，缺乏身经百战的优秀将领，对于正面的作战没有十分的胜算。当时织田势的主力，毕竟已经在信长本阵南方4公里的范围内展开了兵力。
当然，景健与长政回避正面决战而求速战速决，也是对自己军势的机动力充满了自信。
当时的信长，几乎是全盘中了朝浅联军的战略。出其不意地陷入穷凶极恶的险地，信长甚至对自己亲自训练的浓尾精兵的机动力产生了怀疑。
8、形成左翼的德川势的翼延运动
浅井势的先头部队矶野员昌猛攻的激烈程度，远远超出了信长的预想。第一线的坂井队，由于政尚的长子久藏战死，导致坂井队发生大崩溃，只得由池田队顶替而退出了战团，而浅井势也趁机开始越过姊川。
看到战况对本方有利的浅井长政，决定立即派遣生力军突袭信长本阵，希望通过突击使信长直接崩溃。当时信长的马回众防御的渡河点有浅濑和当时矶野队军势的所在地两处，而矶野队正从现在的野村桥和今庄桥中间的东北方向寻求渡河的可能。
被对手攻势压制的织田势，北侧浅濑地区的防御变得薄弱，被长政的生力军乘隙突入，从侧面攻击池田队，使池田队开始后退。但是就在此时，织田势的主力部队，开始陆续以朝仓景健和浅井长政都没有想到的速度到达战场。最先到达的是木下势的柴田势，这使得浅井势的突击开始逐渐失去威力。
在战斗发生时，坂井、池田两队的总兵力，仅仅有大约2000人左右。而当时的崛秀村起初是担任信长旗本的先锋，后来又作为秀吉的寄骑而加入秀吉的麾下，秀吉的兵力也因此达到了接近2000人的数量；柴田队的兵力则大得多，几乎超过了上述三队的合计，达到了3000人以上。此时，织田势的总兵力已经凌驾浅井势之上。
但是，由于坂井队的溃灭、池田队的后退，实质上生力军的入替在效果上并不能改变当时的状况，浅井势仍然迫近至信长的眼前，森可成的马回众也受到攻击。
另一方面，德川势的状况正在一刻一刻地恶化。德川势全军的兵力仅仅相当于朝仓势的先阵的兵力，朝仓势在正面突击被屡次击退的同时，尚有余力将兵力向敌军的左右展开，形成半包围的势态。为了防止被敌军包围，明知兵力居于劣势的德川势仍必须将兵力分散。朝仓势在川中一会被击退，一会又掩杀过来，场面一度形成乱战。
在战场上，被敌军置于包围的趋势中，为了防止被敌军包围，而将自军的侧翼向左右两方展开的机动方式称为延翼。其要点是形成如一枝横枪般的横向连续性阵列。由于兵力上占优势的朝仓势采取侧面迂回包抄的战术，使得德川势不得不为了防止被包围而将部队展开。
按照通说，构成延翼的部队是德川势中属于家康的旗本队，其中包括了本多忠胜、神原康政、本多广孝、本多正信的弟弟三弥等许多德川势的名人。在当时的局面大规模地投入旗本队以抵抗朝仓势的突进，可以看出当时德川势已经陷入苦战，局面相当地紧迫。
9、决定胜负的预备兵力
信长的本阵了解到德川势正陷入苦战，也同时预料到了德川势崩坏将造成的结果。因此，虽然本阵的前面已经展开战斗，信长仍然决定增援家康。跟随木下队北上的丹羽长秀队，及被浅井势压迫而后退的池田势，按照信长的命令向德川势的右翼移动，他们出乎朝仓势意料地沿着姊川移动，突袭朝仓势的左翼。一击之下，朝仓势的攻势顿时受挫，预备兵力的到达也使得德川势从崩溃的饿边缘拉了回来。就在此时，拥有织田势最大兵力的佐久间信盛队到达战场。拥有近4000兵力的佐久间队的参战，使织田势的前线部队倍增，完全阻止了浅井势的突进。
同时，朝仓势为了击破德川势，仍在进行着一进一退的战斗，而且双方都已经投入最后的预备兵力，进入了决战的阶段。在当时，交战各方面所剩余的兵力为：织田势只有马回众及信长的警护数百骑与美浓三人众3000余人，德川势只剩下家康的警护要员，而浅井势也只剩下少数长政的马回，朝仓势中占全军大半的敦贺众6000人非伤即惨。
但此时，战役的主导权已经握在了信长的手中。美浓三人众避开仍在激战的姊川南案，从北岸迂回突入了浅井势的左翼，此时等在最右翼待机的氏家直元、稻叶良通、安藤守就三将，从现在的今庄桥附近渡过姊川，切断了浅井势的后尾。三人众的攻击产生了决定性的后果。在南岸大突出部激战已达到疲劳的极限的浅井势，在三人众的生力军侧面突击之下造成了总崩溃，并败走小谷城。
在浅井势崩坏的同时，朝仓势也力尽了。见到浅井势崩溃的敦贺众开始弃战后退。此时仍在前线激战的诸将也动摇了，开始从川中撤退。虽然朝仓扫部助及鱼住景固仍在奋战，但猛将真柄直隆的战死，使朝仓势的战意消挫，失去了统制的朝仓势也总崩溃了。
获胜的织田·；德川势开始追击，直至双方的战力都耗尽为止，信长的追击一直延续到小谷山麓，实际的追击距离达到了50町