飞鸟井雅继（正五位下左少将，雅教之孙）
庭田重通（权中纳言。※也有可能是其父庭田重保）
高仓永相（前权中纳言）
中山庆亲（正四位下左中将）
四辻季满（从四位下左中将）
薄诸光（正五位下左卫门权佐、左马头）
中御门宣光（正五位下左少辩）
另据《本朝皇胤绍运录》，诚仁亲王的皇子中，三宫（后来的良恕法亲王）和六宫（后来的八条宫智仁亲王）当时也在场，而《晴丰公记》中没有提及。此外，柳原淳光（权大纳言）也一早赶到，他是六月二日在二条御所当值的公家。其后正亲町季秀（前权中纳言）也进入了御所。
面对诚仁亲王所在的二条御所被卷入政变中的异常事态，权中纳言、武家传奏劝修寺晴丰在混乱中往来奔波，试图进入御所。在他的日记《晴丰公记》中详细记载了当时的情景。
政变发生时，晴丰尚在自宅中高卧，被他的家司袖冈越中唤醒，并得知本能寺已陷于明智军的大火中。晴丰大惊，急忙赶去二条御所。此时二条御所已经被明智军所包围，而明智军正在驱赶周围的公家，无法入内。所幸晴丰在明智军中找到了一名叫作井上的武士－－此人居住在京都，与晴丰家是邻舍，因此两人有故。晴丰希望通过井上的交涉能进入御所，一开始也没有得到准许，晴丰万分焦急。后来还是因为井上的努力，终于让晴丰进入御所。在御所中，晴丰见到了满脸杀气的信忠主从和心惊胆战的亲王、公家们。
《晴丰公记》是晴丰的私人日记，因此用语很随意。这里，晴丰写道（直译）：“城介在二条御所参见御王。就这样围困（取つめ）了。村井请让退去。”村井贞胜劝信忠让亲王一家和公家众退出御所外。
注意这里的“就这样围困（取つめ）了”一句，主语和目的都未明言。“取つめ”，作为他动词用法时有“严责、催逼”的意思，因此有日本学者据此认为主语是信忠，此时有胁持亲王作盾牌的意思。然而这种解释很勉强，和上一句“城介在二条御所参见御王”的尊敬语气格格不入，联系事件前后更显矛盾。实际上，“取りつむる”是中世常用的军事用语“围困”，句中省略的主语是“明智军”，晴丰的意思是“就这样（让明智军）给围困了”。
不管怎么说，最后因为村井贞胜的决断，决定让亲王一家离开御所。但是还没有得到围困御所的明智方的承诺，需要先派人去交涉。这一段，传教士路易斯·；弗洛伊斯的《日本史》第五十六章中记载得比较详细：
“京都所司代村井殿下与嗣子在一起，依照他的进言，内里（天皇）的儿子骑在马上，向外面街道上的明智的手下派遣了使者。质问他们想把自己（指诚仁亲王）怎么样，是不是要自己切腹。明智好像无意对殿下有任何举动，希望立刻就让殿下离开御所，只是为了防止城介殿下混在其中逃亡，就回复说马和车驾不能离开。内里的儿子得到报告后，就带着妻室一起上京去他父亲的皇宫了。”
诚仁亲王骑在马上的时候，已经有切腹的思想准备。正因为亲王从信长处得到二条御所，被信长拥立的意识很强。事态至此，也不得不预作与信长同路的准备了。但是明智方面并不想危害亲王，于是请亲王离开，只是不能携带马和车驾。于是，御所内外暂时停战了。
亲王一行离开御所时的样子，正好被京中的儒医江村专斋看到，后来记录在他的《老人杂话》中：
“城介殿未动，阳光院殿（诚仁亲王的谥号）前往禁中。自乌丸（二条御所东面的南北向道路）方向的门而出，没有乘舆，由人背负而去。”
江村专斋是住在京都新在家（京都内的一个区域，在内里之南，与内里隔土御门大路近邻。这里住的都是法华宗的檀家－－即专门为法华宗寺院提供布施的俗家。）的町人，永禄八年（1565）生，宽文四年（1664）殁，幸运地活到了一百岁。本能寺政变那年，专斋十八岁。他年轻的时候通称“甚太郎”，名“宗具”（或作“宗贞”），后依照当时医者的惯例出家，号“专斋”。先后出仕过加藤清正和森忠政。《老人杂话》是专斋后来的谈话集，尽管传闻部分的记事多有误传和夸张，但他亲历的事件则记得颇详细，可信度很高。
亲王一行在新在家附近还遇到了连歌师里村绍巴，绍巴为亲王提供了一架荷舆。荷舆是没有升殿资格的下级公家（“地下”）的乘坐物，虽然很粗糙，但也强似没有。于是亲王就从从人的背上下来，坐在荷舆上继续赶路。这一过程被吉田兼和记入了《兼见别本》。
劝修寺晴丰和一个名叫河胜左近的熟人一起陪伴亲王前往内里。途中，又有权大纳言庭田重保和町人川端道喜赶来护佑。庭田可能是因为担心他在二条御所当值的儿子重通而找来的。川端道喜与专斋、绍巴一样都是住在新在家的町人，是经营糕饼粽子类的富商（知名产品是“元祖道喜饼”），与禁中的关系很密切。其后因为前来护驾这件事，他在六月九日被赏了银子一枚。（以上据《立入宗继文书》、《川端道喜文书》、《晴丰公记》）
●二条御所之战－－信忠的奋战与绝命
现在让我们把注意力再次回到二条御所。
在亲王等离开之后，二条御所内外立时成为了阿修罗地狱般的战场。信忠方在打开的大手门内布置了铁炮、弓箭队，向涌入的敌军猛烈射击，将其击退。也许是由于根本没有生还的希望，信忠方以奋战至最后的决心，殊死作战。战况之激烈，远远超乎明智方的预想。《惟任谋叛记》说信忠方在大门口坚守了“数刻”（一个时辰分作上中下三刻，一刻约合现在40分钟）之久。《莲成院日记》记道：
“其后（指亲王等退去后），开门自内打出，舍生忘死，在御门前血战，三次击退敌军。然以寡敌众，必难久持。真洛中洛外未有之大乱也。”
信忠方不仅在人数上绝对劣势，而且是仓促应战，很多人连甲胄都未备齐，因此防御力也与全副武装的明智军无法相比。虽然背水苦战，以一当十，但大门最终还是被明智方突破，信忠方退回到御殿上，信忠最后的奋战开始了。
《惟任谋叛记》：“信忠御兄弟身着腹卷（一种轻便型的护身甲），身边约百人着具足，信忠带头冲出，直向前斩倒十七、八人。”
“信忠御兄弟”指的是信忠和信长的第五子织田胜长。胜长幼名御坊丸，最初给迎娶信长叔母的美浓岩村城主远山景任做了养子，后来岩村城被武田胜赖帐下的秋山信友攻克，胜长被送往甲斐做人质。政变前半年的天正九年（1581）十一月，希望与信长和解的胜赖将其送还，信长在安土为其元服，取名源三郎胜长，并封给他尾张犬山城。（《信长公记》第十四卷）因尾张是信忠的分国，胜长就成为信忠属下的城主，在信忠进京时一同仕奉而来。不期又遭此大难，实在是非常不幸运的人。
《惟任谋叛记》又接着写道，此时明智军的侍大将明智孙十郎、松生三右卫门、加成清次等拥健卒数百人至，信忠看到后，自其队正中切入，往来拼杀，孙十郎、三右卫门、清次三人皆被其所斩。《惟任谋叛记》的描述或有夸张，但是擅长剑术又无退路的信忠确实凶狠，仿佛剑豪将军足利义辉再现一般。弗洛伊斯在《日本史》第五十六章中也写道：“嗣子战斗非常勇猛，身上多处被铳弹弓矢击伤。”
一方面是信忠方的顽抗，使明智军仅在御所内就折损了数百人，连指挥进攻的总大将，光秀五宿老之一的明智治右卫门也被信忠方的铁炮击成重伤；（《明智军记》第九卷）一方面是明智军的攻势如潮，一波受挫，马上换上第二波继续猛攻（可能也是因为御所内尤其是御殿内面积有限，大军团一时难以一拥而入的缘故）。战斗异常激烈。
攻破了大门的明智军，针对信忠方在御殿上的死战又采用了非常手段。
二条御所旁是太政大臣近卫前久的宅邸。原来的近卫邸从室町时代以来一直被称作“樱御所”，位置在土御门内里的西北角。是信长在天正五年（1577）二条御所竣工后，为表示与近卫家的亲密，特意让近卫家在近邻二条御所的位置营建新宅。因此前久的嫡子内大臣信基住在“樱御所”，前久本人住在二条新邸（因此前久被称作“下之大御所”）。
苦战中的明智军注意到了近卫邸的地势。《信长公记》：“敌军登上近卫殿御殿，自屋顶向下，以弓矢、铁炮射入，（信忠方）死伤甚重，渐近无人也。”闯入近卫邸的明智军爬上屋顶，居高临下向信忠方射击。这是信忠方无法反击的角度，士卒死伤殆尽。而《明智军记》中则说：“敌城（二条御所）之北乃近卫殿之下馆，有屋舍颇高大。”“使兵登之，以玉火矢、棒火数十挺望城中打入，本丸燃起大火。”玉火矢就是火药箭；棒火是一种燃烧弹，形如短而粗的箭，棒内装满火药，用大筒发射。按照《明智军记》，爬上近卫家屋顶的明智军，不仅狙击信忠方的武士，而且使用火器点燃了御殿的大火。
明智军的这一招很见效，御殿四方起火，信忠方再也无法应对，命运终结的时刻即将来临了。最后关头，在历史上默默无闻的人们留下了不少动人的逸话。
信忠的近侍下方弥三郎是自幼年时起就陪伴信忠，从小姓一直培养起来的。奋战到最后，他的左脚和腹部都受了重伤，肠子也流了出来，一边包扎着伤口来到信忠身边。这时信忠同样多处负伤，抚慰弥三郎道：“可谓勇锐。然而今生不及恩赏，且冀来世相会吧。”两人相视一笑，年龄相仿的两个年轻人之间的亲近感此时远远超越了主从关系。之后弥三郎又走出向明智军挑战，战死时二十九岁。（《士林溯洄》）
信忠吩咐担任介错（切腹的助手）的镰田新介（或谓为“五左卫门”），揭开走廊的地板，把自己的遗体藏匿于其下。说完就切腹自尽了。残存的家来们也都排坐着切腹为信忠殉死。新介在负责介错后，依照遗命将尸体藏好。因此信忠的尸体没有被明智军发现，而是与御殿一起在红莲烈焰中归为灰烬。信忠享年二十六岁。（《信长公记》第十五卷、《惟任谋叛记》）
但是新介并没有为信忠殉死，而是活着逃离了二条御所。十几年后丰臣秀吉侵略朝鲜时，他战死在“高丽的南门”。（《山鹿语类》第十五卷）《明智军记》说新介跳入一口一丈深的井内，在井下的大石头后藏身，一直躲到深夜之后，才偷偷的溜走，从而死里逃生。新介的这种举动是违反当时道德的，因此受到责难。相反，也有主动赶来尽节的。
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美浓住人松野平介一忠得知事变发生，立即前往助战，但是晚了一步，在途中就得知了信长父子的死讯，于是就前往位于三条坊门押小路的妙显寺（在妙觉寺西），准备追腹（即追随死去的主君而切腹）。光秀的宿老斋藤利三与平介相知，派人前去劝说他不要自尽，并且邀请他出仕明智家，为平介所拒绝。平介认为，自己接收了信长过分的恩赏，在最要紧的时刻却没有尽到力，再要投降敌人真是莫大的耻辱。平介本是医生，也通晓歌道，便作下辞世句“その時に消え殘る身の浮雲も終には同じ道の山風”和偈子一首“手握活人三尺剑，即今截断尽乾坤”，随后切腹自尽。（《信长公记》第十五卷）对于平介的死，《惟任谋叛记》中评价道：“寔当世无双之举也。”
无独有偶，一位名叫土方次郎兵卫的谱代众，宿在较远的上京柳原，没有来得及赶上战斗，于是也追腹而死。
在二条御所的战斗中，信忠方的死殁者除了信忠、胜长兄弟外，还有信忠的叔父津田又十郎（织田长利）和津田勘七、津田九郎二郎（元嘉）、津田小藤次等一门，村井父子三人（贞胜、贞成、专次），信长奉行众的菅屋长赖、福富平左卫门、野野村三十郎，马回众的团平八、斋藤新五郎、坂井越中、毛利新介等，或战死，或自尽。
《信长公记》中，除了信忠以外，总共提到了61个战死者的名字。这只是有名有姓的武士的数字，加上身份低微没有留下名字的，实际数量必定远大于此。《家忠日记增补追加》称“