《考博生化和分子生物学复习笔记》

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考博生化和分子生物学复习笔记- 第16部分


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调节:MAPK激酶…MAPKK(MEK)。
下游底物:核内转录因子如Myc,Jun,Ets及其它胞内蛋白.
(二)酪氨酸蛋白激酶(Tyrosine protein kinase,TPK)—特异地催化蛋白质的酪氨酸残基磷酸化,蛋白质酪氨酸磷酸化在细胞生长,分化和转化的调节中起重要作用。
1、经典的src激酶家族  原癌基因c…src蛋白产物Src是一种酪氨酸蛋白激酶,它有三个基本结构域:从C…端至N端依次为SH1、SH2,SH3(SH=src homolog)。                                                         生物病毒免疫学习 
SH l结构域:具酪氨酸激酶活性,
SH2结构域:能识别并结合含磷酸化酪氨酸的短序列,
SH3结构域:通过脯氨酸和疏水性氨基酸残基与靶蛋白结合,
Src家族:包括原癌基因src,yes,lyn,fyn,lck,blk,fgr,bcd和yrk编码蛋白,它们都有TPK活性.共同参与细胞转化的信号转导过程.
SH2结构域在信号转导途径中的重要作用:由于含SH2结构域的信号转导分子可以识别和结合其他含磷酸化酪氨酸的蛋白,因此,通过蛋白质的酪氨酸磷酸化/去磷酸化调节可以决定信号转导分子的结合与解离,从而导致信号的开启或关闭。
2、JAK嫩酶家族  JAK(Janus kinase)激酶家族包括Jakl,Jak2,Jak3,Tyk2等,  Jak激酶具有一个TPK结构域和一个激酶样结构域,它们与Src的TPk激酶结构域具有同源性,但JaK激酶没有SH2,SH3结构域;Jak激酶主要参与细胞因子的信号转导.
二、蛋白磷酸酯酶对磷酸化的调节
(一)、丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酯酶 这类酶选择性地作用于含磷酸丝氨酸或磷酸苏氨酸残基的肽链,使之脱去磷酸基团并改变生物活性.
主要成员:PPl,PP2A,PP2B,PP2C,等. PP2A,催化亚基及其功能.
(二)酪氨酸蛋白磷酸酯酶(PTPase) 蛋白质酪氨酸磷酸酯酶催化磷酸化酪氨酸残基的去磷酸化反应,与相应的酪氨酸蛋白激酶共同调节蛋白质的磷酸化水平,  PTPase家族可分为2类:
1、胞质型(非受体型):小的可溶性蛋白,只有一个催化结构域, 特点是合有SH2 domain,如PTPlC,,PTPlB等.,
2.受体型(PTPR),是大的跨膜蛋白,特点是有2个串联的胞浆催化结构域,如白细胞共同抗原CD45,
PTPlC(存在于造血细胞):N端2个串联重复的SH2结构域{识别TyrP,并指导蛋白与蛋白结合),C端为磷酸酯酶催化结构域。
Jak可作为PTP1C底物.    PTPase基因可能是肿瘤抑制基因.
第三节细胞膜受体介导的信号转导
一、受体的分类  质膜受体和胞内受体(胞浆或核受体,如类固醇激素受体)膜受体的分类:
(一)G蛋白耦联受体家族  又称为七次胯膜受体家族,特点是具有七段跨膜的α螺旋结构,本身无酶活性,胞浆侧肽链上有磷酸化位点,受体功能受磷酸化调节。成员;肾上腺素受体、多巴受体、视紫红蛋白等。
(二)酪氨酸激酶受体家族  受体本身胞浆侧有蛋白酪氨酸激酶活性,并且胞浆侧肽链上有自身磷酸化位点,配基结合后受体形成二聚体,二聚体中每个亚基可以磷酸化对应的另一亚基,从而启动信号转导。
这类受体主要包括多数生长因子受体(如IGF,EGF,PDGF,NGF,SCF,HGF等生长因子的受体),除胰岛素受体外,这类受体均由一条肽链组成.
(三)细胞因子受体家族  这类受体本身无TPK活性,但其胞浆侧近膜部分有非受体酪氨酸蛋白激酶的结合位点,在配基与受体结合后,受体发生二聚化或寡聚化,并激活Jak族蛋白酪氨酸激酶.此类受体包括细胞因子受体以及生长激素、促乳素等受体.细胞因子(cytokine):是淋巴细胞和造血细胞产生的一大类对细胞生长和分化有调节作用的蛋白因子。包括干扰素(IFN)、白细胞介素(IL)、白血病抑制因子(LIF)、抑癌素M等 (但IL…8R为G蛋白藕联受体)
(四)离子通道受体  与配基结合后构成离子通道,主要存在于神经突触,如乙酰胆碱(ACH),5…HT受体等。
二、G蛋白介导的信号转导 G蛋白藕联受体的信号转导途径由三部分组成:
①细胞膜受体;②G蛋白③效应物(effector),其中G蛋白将受体与效应物藕联.
G…蛋白(G…protein)是一种鸟苷酸结合蛋白,是由α、β和γ三个亚基组成的异三聚体, 多,β和γ亚基总是紧密结合在一起作为一个功能单位Gβγ
Gα亚基可分为Gs;Go;Gi;Gq等,其活性可被霍乱毒素(CT)或百日咳毒素(PT)修饰。
G…蛋白介导的信号转导的机制:G…蛋白循环。
G…pr的效应物:离子通道、腺苷酸环化酶、磷脂酶C、磷脂酶A2等
三、RAS…MAPK信号转导途径  1、途径中的信号分子
Ras:具鸟苷酸结合活性的一种胞浆蛋白(与G…蛋白不同)
Ras活性与其结合的鸟苷酸有关。
鸟苷酸交换因子(SOS)
RasGDPRasGTP
(失活)GTP酶激活蛋白(GAP)(激活) 
接头蛋白:生长因子受体结合蛋白Grb2,通过其SH2结构域与Tyr被磷酸化的受体结合,同时通过其SH3域与具有pro富集区的SOS结合,并通过SOS活化Ras蛋白.
2、Ras…MAPK途径:生长因子→生长因子受体(具酪氨酸激酶活性)→含有SH2结构域的接头蛋白(如Grb2)→鸟苷酸交换因子SOS→Ras…GTP→Rafl→MAPKK(MEK)→MAPK→转录因子→调节基因表达。
3.Ras…MAPK途径的调节 ①Ras…MAPK途径中信号转导分子的突变(如Ras)和表达量的改变.②其他信号转导途径的影响
cAMP…PKA:抑制Raf…1;PKC:活化Raf~l,
四、Jak…stat途径:STAT:信号转导物与转录激活剂(signal transducer and activators of transcription)
至少6种,分子量84…113KD,含一个SH2结构域(羧端),一个SH3样结构域,并合有DNA结合域,Stat的激活依赖通过磷酸化形成二聚体.
Jak…Stat途径:细胞因子→受体(二聚体化)→Jak→Stat→Stat二聚体(活化)→易位至核,影响转录.
拓扑异构体的互变由拓扑异构酶催化。发生一条链或两条链的断开和连接。拓扑异构体:具有完全相同的碱基顺序;但L 值不同的超螺旋。分为I; II 型两种拓扑异构酶:Topoisomerase I ; II 
                                 生物化学  分子生物学  考研复习 经典 笔记          
经典填空、选择、判断题通用的总结555句…必背!!!
1。 将两种旋光不同的葡萄糖分别溶与水后,其旋光率均逐渐变为+52。7°。,称为变旋现象。
2。 羟甲基在糖环平面的上方的为D…型,在平面的下方的为L…型。在D…型中,半缩醛羟基在平面的下方的为α…型,在平面的上方的为β…型。
3。 一切糖类都有不对称碳原子,都具旋光性。
4。 区分酮糖、醛糖用Seliwanoff反应。
5。 天然糖苷多为β…型。
6。 糖醛酸是肝脏内的一种解毒剂。
7。 自然界存在的糖胺都是己糖胺。
8。 麦芽糖为'α…D…葡萄糖…α(1→4)…α…D…葡萄糖苷',异麦芽糖为'α…D…葡萄糖…α(1→6)…α…D…葡萄糖苷',蔗糖为'α…D…葡萄糖…α,β(1→4)…果糖苷',乳糖为'半乳糖…β(1→4)…α…D…葡萄糖苷',纤维二糖为'α…D…葡萄糖…β(1→4)α…D…葡萄糖苷'。
9。 直链淀粉成螺旋状复合物,遇碘显紫蓝色,碘位于其中心腔内,在620——580nm有最大光吸收。支链淀粉分支平均有24——30个葡萄糖,遇碘显紫红色,在530——555nm有最大光吸收。糖原遇碘显棕红色,在430——5490nm有最大光吸收。
10。 与糖蛋白相比,蛋白聚糖的糖是一种长而不分支的多糖链,即糖胺聚糖。其一定的部位上与若干肽链连接,糖含量超过95%,多糖是系列重复双糖结构。
11。 糖蛋白是病毒、植物凝集素、血型物质的基本组成部分,Fe2+、Cu2+、血红蛋白和甲状腺素转运蛋白是糖蛋白,它们分别叫转铁蛋白、铜蓝蛋白、触珠蛋白、甲状腺素结合蛋白。参与凝血过程的糖蛋白有:凝血酶原、纤维蛋白酶原。
12。 血型物质含75%的糖,它们是:岩藻糖、半乳糖、葡萄糖、半乳糖胺。
13。 木糖…Ser连接为结缔组织蛋白聚糖所特有。
14。 动植物体的不饱和脂肪酸为顺式,细菌中含脂肪酸种类少,大多为饱和脂肪酸,有的有分支。
15。 分析脂肪酸混合物的分离用气液柱层析,即气液色谱技术。
16。 甘油三酯、甘油单酯形成小颗粒微团,叫micelles。
17。 烷基醚脂酰甘油含有2个脂肪酸分子和一个长的烷基或烯基链分别与甘油分子以酯键、醚键相连。
18。 糖基脂酰甘油中,糖基与甘油分子第三个羟基以糖苷键相连。
19。 磷脂根据所含醇类可分为甘油磷脂类和鞘氨醇磷脂类。
20。 不饱和脂肪酸常与甘油分子的第二个碳原子羟基相连。
21。 肝脏、心肌中的甘油磷脂多为磷脂酰肌醇,脑中的甘油磷脂多为磷脂酰肌醇磷酸、磷脂酰肌醇二磷酸。
22。 缩醛磷脂中一个碳氢键以醚键与甘油C1羟基相连。
23。 除了11…顺…视黄醛外,多数直链萜类的双键均为反式。
24。 柠檬油的主要成分是柠檬苦素,薄荷油的主要成分是薄荷醇,樟脑油的主要成分是樟脑。
25。 胆石几乎全是由胆固醇组成,它易与毛地黄核苷结合沉淀。
26。 脊椎动物体内,胆酸能与甘氨酸、牛黄氨酸结合成甘氨胆酸、牛黄胆酸。
27。 蟾毒不以糖苷而以酯的形式存在。
28。 前列腺素是花生四烯酸及其他不饱和脂肪酸的衍生物。分为PGA、PGB、PGD、PGE、PGF、PGG、PGH、PGI等八类,其功能有:平滑肌收缩、血液供应、神经传递、发炎反应的发生、水潴留、电解质去钠、血液凝结。
29。 在tay…sachs病中,神经节苷脂在脑中积累。
30。 按生理功能,蛋白质可分为酶、运输蛋白、营养和贮存蛋白、收缩蛋白运动蛋白、结构蛋白质和防御蛋白质。
31。 胱氨酸、酪氨酸不溶于水。脯氨酸、羟还能溶于乙醇或乙醚中。
32。 氨基酸分类:①按R基的极性,可以分为:Ⅰ、非极性R基氨基酸:Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro。Ⅱ、不带电荷的极性氨基酸:Ser、Thr、Tyr、Asn、Gln、Cys、Gly。Ⅲ、带正电荷的极性氨基酸:Lys、Arg、His。Ⅳ、带负电荷的极性氨基酸:Asp、Glu。②按R基的化学结构分:脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环族氨基酸。
33。 锁链素的吡啶环结构由4个Lys侧链组成,只存在于弹性蛋白中。
34。 氨基酸的旋光符号和大小取决于其R基的性质,并与测定时溶液的PH值有关。
35。 在远紫外区,氨基酸均有光吸收,但在近紫外区(220——300nm),只有Tyr、Phe、Trp等氨基酸有光吸收。因为其R基含有苯环共轭双键系统。
36。 含有1氨基1羧基和不解离R基的氨基酸均有类Gly的滴定曲线。
37。 PI以上的PH,氨基酸带净负电荷,在电场中向正极移动。
38。 氨基酸氨基的一个H为烃基(包括环烃基及其衍生物)取代,如2,4…二硝基苯(FDNB)在弱碱溶液中发生亲核芳环取代而生成二硝基苯基氨基酸(DNP…氨基酸),即烃基化反应。
39。 蛋白质的化学修饰,是在较温和的条件下,以可控制的方式使蛋白与某种试剂(称化学修饰剂)起特异反应,以引起蛋白质中个别氨基酸侧链或功能团发生共价化学改变。
40。 酪氨酸的酚基在3和5位上容易发生亲电取代反应,它也可以与重氮化合物(如对氨基苯磺酸的重氮盐)结合成桔黄色化合物,叫Pauly反应。组氨酸的侧链咪唑基与重氮苯磺酸结合成棕红色化合物。
41。 蛋氨酸侧链上的甲硫基是一个很强的亲核基团,与烃化试剂如甲基碘容易形成锍盐,该反应为巯基试剂所逆转。
42。 半胱氨酸的巯基能打开乙撑亚胺(即氮丙啶)的环,生成的侧链带正电荷,为胰蛋白酶的水解提供一个新的位点。
43。 巯基的氧化的底物是巯基与金属的络合物。
44。 逆流分溶仪只用于制备分离,如蛋白质、肽、核酸和抗生素等的分离提纯。
45。 肽键的结构实际是一个共振杂化体,由于氧电挨离域形成了包括肽键的羧基氧、羧基碳、酰胺氮在内的O…C…N π轨道系统。
46。 双缩脲反应是肽、蛋白所特有的。
47。 嗜热菌蛋白酶含锌和钙两种金属。
48。 牛胰核糖核酸酶是测定一级结构的第一个酶分子,有124个残基组成,分子内含有4个二硫键。
49。 同源蛋白质是指不同机体实现同一功能的蛋白质,它的氨基酸顺序中这样的相似性被称为顺序同源现象。
50。 凝血酶属于丝氨酸蛋白水解酶类。
51。 蛋白人工合成中氨基保护基有苄氧甲酰基、三苯甲基、叔丁氧甲酰基、对甲苯磺酰基,可
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