骸笩o論社會形態為何，在其所容迹纳a力全部發摚С鰜碇埃^不會滅亡；而新的、更高的生產關係，在它存在的物伲鼦l件於舊社會的胎胞裡成熟以前，也絕不會出現。」（裕┗蛟S馬克思採迹麃啴敗に姑艿姆治觯袊诤谋M她所能「容迹沟纳a力，但馬克思也認為，西方人有能力將「新的、更高的生產關係」的種籽深埋在中國的土壤裡，因為中國（馬克思在別處寫道）擁有一種「化石般的社會生活形態。」（裕撸┧栽谀撤N意義上，西方帝國主義的侵略摧毀中，也蘊含了建構設性的效果：弱化中國的傳統結構，加速了無產階級革命成功的到來。
馬克思對中國的觀照在此打住。到了一八六二年，他日益厭倦、好譏諷有關太平天國種種恐怖行跡。馬克思亦未因新的叛亂——即在太平天國遭掃蕩之前就開始在中國北方蔓延的捻亂——的迅速爆發而稍感寬慰。杖缢c恩格斯在《共產黨宣言》中以生動的筆眨鶖⑹龅模弘m然「這危險的階級、社會的渣滓，是舊社會底層中消極腐朽的部分」，有時也會被捲入革命邉拥暮榱鳎钺岵幻庥謺䲟u身一變，作為「反動陰旨倚匈V收買的工具」。（裕耍�
然而在馬克思其他有關中國的文章裡，我們依然可以清晰覺察到在他腦海中縈繞的一個堅實觀點。馬克思反思，歐洲反動分子在不久的將來，面對與之對抗的憤怒無產階級，而奔逃至他們曾經視為保守力量的最後堡壘尋求庇護，那時他們可能會錯愕地發現，在長城上鏤刻著幾個顯眼的字樣：「中華共和國：自由、平等、博愛。」（裕牛�
捻亂
一般把捻亂爆發的時間定在一八五一年，即太平天國正式宣佈成立的同一年，但究其濫觴實可追溯至一七九○年代流竄於淮河以北的盜匪，特別是在山枺髂稀⒔K西北、河南枺胁颗c安徽北部的數省交界地帶。「捻」這個字在中國亦眾說紛紜、莫衷一是，或因打家劫舍時臉部塗抹偽裝而得名，或指在夜晚搶劫民宅時捲紙作為照明的火把，或者僅指俜孙h忽不定的作亂形態。
捻匪不似太平天國，並洠в衅鞄悯r明的宗教淵源、政治立場、戰略目標，或統一的領導。但在十九世紀的前半葉，捻匪的數量或勢力均日益坐大。若干捻軍與白蓮教團體、「八卦教」（Eight Trigrams）教眾或三合會彼此掛勾，有的則是與靠販咚禁｝營生的龡n互通一氣。不過捻匪大都是貧農出身，他們在土壤貧瘠、寒風刺骨，以及因水利系統年久失修而導致洪澇頻仍的惡劣環境中苟活。當地普遍殺女嬰的風氣使得性別比例嚴重不均；捻匪之中，約百分之二十的人無法成家，致使他們無以寄託、行綜不定，不論何時，均得以嚕Ь劢Y黨，流竄各地。地方鄉里雖然透過成立鄉勇，構築城牆，編組巡邏等方式護衛桑梓，但捻匪依然能襲擊鄰近村莊，掠奪農作物、搶劫痰倪輸船隻、綁架富裕地主，甚至劫獄以救同夥。
一八五一年後，江蘇以北部爆發嚴重洪災，使原本的艱困生活雪上加霜，與捻匪素有瓜葛的百姓群起暴動，被朝廷視之為叛亂。一八五五年，太平天國佔據南京兩年後，黃河水位暴漲，衝垮開封一帶的主要河堤，造成黃河改道，轉向山枺雿u北岸灣口出海；隨之而來的災難讓捻匪的聲勢坐大。此時，捻匪的組織形態也更趨緊密：一八五二年，十八個捻匪組織的首領公開推舉皖北大地主、販賣私秊樯膹垬沸袨楣仓鳌Ｒ话宋辶辏瑥垬沸斜还茷椤该酥鳌梗ㄌ枴复鬂h明命王」。捻匪劃分為五大「旗」，分別以不同的顏色命名，而每一旗則是由各鄉里間同姓的叛亂者組成。
捻軍中能打仗的可能只有三萬到五萬不等，但他們造成的影響卻與人數不成比例。捻軍中有許多人是騎兵，又擁有槍械，所以得以切斷京師和包圍南京城的官軍之間的聯繫。在淮河以北，捻軍構築厚城，挖掘深壕，並配備大砲防守，建立許多根據地，使他們的軍隊在蹂躪村莊後得以撒退至安全地帶。此外，也有其他村莊市鎮自行搆築防禦工事，以逐退叛亂團體，故在淮河以北，各式鄉勇縱橫交錯。擁有防禦工事的村莊會與鄰近的捻軍城寨訂立「和平條約」，約定互不侵犯。有時，還會支付銀兩或鴉片權充「保護費」。
這一帶農村殘破的程度無法正確估計，但勢必十分嚴重。張樂行在一份報告中寫道，若躲避捻軍，地方百姓的生活就更悲慘。「但我兵所過，爾等自相驚恐，攜資逃避。無賴之徒，乘間截奪。家無守戶，又被其燒。及至回歸，兩地皆空。是有救之名，而成害之實也。」（裕Ф穑┠碥娛最I縱使三令五申；嚴禁姦淫擄掠，但遏阻作用卻是微乎其微。對兵丁而言，在荒蕪的農田裡搜尋蔬菜、狩獵野味、綁架富賈、劫奪地方商隊都是家常便飯。有時捻軍在返回根據地途中，賤價出售在別處洗劫的戰利品，以博得地方上的聲望。
捻軍的頭號勁敵是僧格林沁將軍，他出身北京蒙古王公之家，曾任「領侍衛內大臣」。一八五三年，僧格林沁在距天津不到二十五哩處擊潰北探的太平軍，一八五九年更以完備的防禦工事在大沽逐退來犯英軍，從而威名遠播。但在一八六○年，因防守失利讓英軍長驅直入京師而被降罪，同一年稍後，僧格林沁承命剿滅捻亂。僧格林沁驍勇剽悍，帶領一支滿、蒙組成的精銳騎兵，追擊捻軍不捨，最後在皖北合圍捻軍，斬殺了張樂行。不過僧格林沁同樣讓地方百姓懼怕；他放任兵丁恣意邸な芯∶瘢瑩勊谏斐鲈种斑�曾向地方索賄。杖缫幻賳T所說：「詎知官兵之擾害，更甚於佟！梗ㄔ＇二一）
其他捻匪酋首很快就取代張樂行的地位。他們成功發展出一套游擊戰略，得以自官軍的攻擊中全身而退，官軍最後兵疲馬困，並受制於地形而逐漸割裂為小單位。此時，重新整軍的捻匪就能以帶矛步兵、攜劍騎兵的優勢兵力打擊官軍。捻軍經常採取嚴酷的堅壁清野戰略，把官軍誘入寸草不生、住屋船舶盡毀、水井已用石頭封死的地方。一八六五年，捻軍正是利用這種作戰策略，誘使僧格林沁的軍隊在江蘇、河南與山枺≈g疲於奔命，最後僧格林沁铡新穹粴ⅲ矸藠Z取逾五千匹的戰馬。
朝廷為因應變局，隨即召喚剛贏得南京大捷的曾國藩，命其督師剿捻。除非曾國藩能籌种茉敚诮K、安徽、河南，與山枺氖〗嬡娛聯c，並加強主要河道、吆拥姆蓝R工事以咚图Z秣，否則無法徹底剿滅捻匪。此計畫還需挖掘吆印锨宰钄_捻軍的騎兵活動，並以唤j政策與甄選新的村長等手段，有系統地爭取各方村民作為後盾。不過此一戰略部署未竟全功，因為四省巡撫無法通力合作，加之南京城收復後，曾國藩即解散不少湘軍精銳之師。故曾國藩在剿捻時就只能倚重同僚李鴻章麾下的軍隊，此時李已位兩江總督要津。李鴻章能穩定供給曾國藩所需的軍餉，而曾的兵勇大都徵募自安徽，以流經皖北的河流為名的「淮軍」，但這支軍隊卻未能完全聽命於曾國藩。於是朝廷將兩人職務對眨衫铠櫿鲁鋈谓四斫y帥，曾國藩轉任兩江總督。
這次職務對眨癸@了權柄流入地方團練將帥手中後，形成的政治新格局的眩s性。李鴻章將政治生涯平步青雲歸於曾國藩的提攜，因其年輕時擔任過曾國藩的幕僚。李、曾二人的政治生涯不僅錯綜糾結，還各自指摚б恢к婈牎＠铠櫿略诮四碇跻苍龅筋愃粕窳智呋蛟鴩洑v過的逆境。捻軍總是有辦法突破封鎖線逃逸，甚至還往西北流竄，遠抵陝西，而進到西安、延安。杖缋铠櫿碌臄⑹觯骸纲綜飄忽，我軍與為躡逐。」（裕Ф┤欢鴿u進、穩健的消耗戰，導致分裂的捻匪於一八六八年全面潰敗。按中國人的標準，淮軍的餉銀十分優渥，且忠於李鴻章及麾下諸將的指摚АＫ麄兪褂觅徸匝笕说膩砀屌c西式大砲，在北方水域開始部署砲艇。另外有外國武裝戰艦——其中有兩艘戰艦名為「孔夫子號」（Confucius）、「柏拉圖號」（Plato）——在山枺睾Ｍ鶃硌策墸拦犇矸艘萏樱｛到因〈天津條約〉、〈北京條約〉條款而蓬勃發展的貿易活動。
一八六八年八月，官軍在山枺鼩v經一番激戰終於戰勝，盡屠被圍困的捻軍殘部，清廷前往太廟、武廟祭天。李鴻章受到清廷的不次拔擢，加封太子太保銜。曾國藩在收復南京城後加官晉爵，而李鴻章的穩固仕途也是建立在敉平叛亂的功勳之上。曾國藩殻熟兑话似叨辏八麃K洠в卸嗌贂r日享受崇榮的地位，但李鴻章卻配享高壽。往後三十載，李鴻章儼然是中國權傾一時的宰輔。
回亂
自唐代（西元六一八年至九○七年）以降，已有穆斯林（ Muslims）定居中國，有些是從中亞至中土經商，最後在甘肅、陝西落腳；另有阿拉伯的貿易商經常往來於福建、廣枺葨｜南沿海城鎮。及至晚明時期，許多穆斯林與中國人通婚，使中國穆斯林（即所謂「回部」）聚落數目大增，帶給地方行政管理極大的困擾。耶穌會傳教士利瑪福г涗浭呤兰o初卜居中國的回民人數。乾隆一朝，回民掀起數次暴動；十九世紀初，由浩罕汗發起的拢龖穑╦ihad）使滿清治下的喀什噶爾、葉爾羌邊疆地區常常動盪不安。受到捻亂波及的華北農業地帶，尚有可觀的回民聚落分佈其中，人數甚至可能超過一百萬：在河南、安徽可看到人聲鼎沸的清真寺，回民有專屬的私溬u管道。倘若發生涉及漢回衝突的案件，法律判決通常較偏袒漢人，宗教暴動與漢回反目等事件屢見不鮮。
除甘肅、陝西外，中國本土的回民大抵集中在西南地區，特別是雲南一省。回人移居此地的歷史可追溯至十三世紀蒙古征服中國時，而與漢族住民的齟齬始終時有所聞。在太平天國逐漸強化南京的統治，捻軍開始串聯之際，雲南在一八五五年也出現三股反清的叛亂團體。暴動的肇因是繁苛的土地稅與北京強加在雲南回民身上的苛捐雜稅，加之雲南的財源——金礦、銀礦又發生礦權糾紛，致使回民的處境更為艱困。漢人本身礦產已枯竭，意圖驅逐回民強佔礦區。暴動與颍齺y導致漢人大規模攻擊回民，回民反擊，佔據滇西重鎮大理，圍攻滇省首府昆明。一八六三年，回民叛軍一度佔領昆明，旋即被清軍奪回。不過，回民叛軍首酋杜文秀在大理自稱「蘇雷曼蘇丹」（Sultan Suleiman），建國號為「平南國」，這個名稱實仿自太平天國。
雲南當地的官員昏聵無能，同時又囿於地形，不易興兵征討，尤其是歷經苗族、宗教教派等亂後，回民勢力趁機擴展至雲南、四川、貴州三省交界的山區地帶。朝廷以離間回民勢力，獎賞回民變節者，組織地方防禦力量，並倚重幹練的巡撫經略地方，加緊壓迫回民叛軍。一八七三年，大理在激戰後陷落，杜文秀自殺未遂，後被清軍捕獲、處決。
因為地形限制和距離遙遠，雲南回民難與陝、甘爆發的另一股回亂互通聲氣。這次回變始於一八六二年，是受到太平天國將領的慫恿，以牽制官軍，解南京之危，而捻軍亦於一八六○年代中葉流竄至此，尋求同盟。甘肅境內與陝西南方有可觀的回民人口，其中多數信奉自中亞神秘教派蘇菲教（Sufism）的「新教義」（ New Teaching）。一七八一到一七八三年間的一連串回民暴動，促使清廷嚴格禁止新教的活動，不過清廷的禁令只是徒增民怨而已。
一八六二年西北回亂似乎源於地方上的漢回種族衝突，而非特殊的教派或以反清為訴求。原本就已不穩定的局勢復因太平軍的劫掠而益形惡化。當地民眾仿效枺俊⒈狈降囊驊溃娂娊M織團練鄉勇捍衛家園，以抵抗太平軍的威茫蝗绱艘粊恚刈迮c漢人各自建立團練。由於大部分八旗兵丁被抽眨プ方颂杰娕c捻軍，加之地方綠營本身即是回人充任，清廷在此地的統治權威十分薄弱，只能聽任局勢持續惡化。暴動起因於一件小意外——一群回民與一名漢族商人因竹竿價格爭吵，最後導致鬥毆，漢人群集，在士紳率領下，沿著渭水攻擊、燒毀回民村落，殺害無辜的回人。回民則是群起攜械向漢人（以及拒絕攜帶武器的同一教派教眾）發動報復攻擊，六月底，回民圍攻陝南最繁榮的兩座城市——潼州與西安。
此地官軍起初因將帥無能而未應變，嗣後朝廷雖眨蓚艹鰧㈩I指摚В廊伙柺苁繗獾吐洹⒁甙O叢生與虧欠餉銀等挫折所擾。是故，兵勇棄甲逸逃司空見慣。縱使清軍死守西安、潼州，但周遭鄉村地帶